More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47473 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_47473  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.355381 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08869  cytosine deaminase-uracil phosphoribosyltransferase fusion protein (AFU_orthologue; AFUA_5G05460)  66.35 
 
 
249 aa  300  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225735  hitchhiker  0.000000000147519 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02100  uracil phosphoribosyltransferase 1, putative  65.22 
 
 
231 aa  284  5.999999999999999e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.995833  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_47740  predicted protein  44.78 
 
 
434 aa  224  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0678521  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1695  phosphoribosyltransferase  41.83 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.159476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00474  conserved hypothetical protein  37.85 
 
 
263 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
211 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
203 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  37.75 
 
 
582 aa  143  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
207 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07502  uridine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05430)  37.25 
 
 
410 aa  141  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26336  predicted protein  41.24 
 
 
179 aa  141  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  39.27 
 
 
209 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
208 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 
209 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
210 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
209 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
209 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
209 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  41.97 
 
 
209 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
209 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
208 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 
208 aa  134  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  41.97 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02630  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
209 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
209 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 
209 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
208 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
209 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
209 aa  132  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
205 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 
207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 
213 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2095  uracil phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
211 aa  128  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
209 aa  128  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1818  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
208 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  38.34 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  37.37 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0996  uracil phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.688134  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1448  uracil phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0997  uracil phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
370 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  36.98 
 
 
209 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002782  uracil phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03199  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  40 
 
 
216 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 
211 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  39.47 
 
 
216 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
214 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
214 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
208 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2169  uracil phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
209 aa  124  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.215799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1078  uracil phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 
208 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  124  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 
211 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2386  uracil phosphoribosyltransferase  39.47 
 
 
216 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3121  uracil phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
208 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116338  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1736  uracil phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
208 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000718639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0911  uracil phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
208 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1235  uracil phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
208 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0527635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1731  uracil phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
208 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00552662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>