225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43698 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43698  predicted protein  100 
 
 
618 aa  1276    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237593  normal  0.455803 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05110  YdiU domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07640)  34.27 
 
 
603 aa  304  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.991992  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  31.24 
 
 
483 aa  230  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  32.92 
 
 
518 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  30.74 
 
 
510 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  30.8 
 
 
498 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  32.02 
 
 
518 aa  220  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  33.47 
 
 
495 aa  219  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  33.68 
 
 
495 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  30.78 
 
 
492 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  32.23 
 
 
483 aa  217  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  31.06 
 
 
520 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  29.86 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  29.86 
 
 
483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  31.64 
 
 
529 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  28.67 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  32.85 
 
 
525 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  31.64 
 
 
529 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  31.31 
 
 
483 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  30.86 
 
 
507 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  31.33 
 
 
492 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  30.83 
 
 
483 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  30.43 
 
 
483 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  32.56 
 
 
518 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  29.18 
 
 
480 aa  211  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  29.69 
 
 
505 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  30.25 
 
 
522 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  30.42 
 
 
499 aa  210  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  31.37 
 
 
500 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  30.25 
 
 
522 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  30.6 
 
 
525 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  30.25 
 
 
522 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  30.6 
 
 
525 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  30.25 
 
 
522 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  30.6 
 
 
521 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  29.52 
 
 
565 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  30.26 
 
 
491 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  30.6 
 
 
525 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  30.6 
 
 
525 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  30.6 
 
 
521 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  30.6 
 
 
521 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  30.25 
 
 
522 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  30.97 
 
 
504 aa  207  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  30.27 
 
 
518 aa  206  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  30.91 
 
 
521 aa  206  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  30.77 
 
 
488 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  30.64 
 
 
522 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  30.07 
 
 
487 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  29.83 
 
 
497 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  30.67 
 
 
540 aa  204  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  30.36 
 
 
496 aa  204  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  30.31 
 
 
544 aa  203  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  29.64 
 
 
522 aa  203  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  30.53 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  31.77 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  31.03 
 
 
503 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  30.92 
 
 
500 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  29.65 
 
 
488 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  30.43 
 
 
491 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  29.98 
 
 
492 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  30.22 
 
 
548 aa  200  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  30.49 
 
 
476 aa  200  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  29.88 
 
 
480 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  29.88 
 
 
480 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  29.73 
 
 
491 aa  200  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  30.48 
 
 
491 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  29.88 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  29.85 
 
 
478 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  29.88 
 
 
480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  29.92 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2147  hypothetical protein  31.47 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354492  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  29.88 
 
 
480 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  29.56 
 
 
494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  29.68 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  29.68 
 
 
478 aa  197  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  30.81 
 
 
500 aa  197  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  36.72 
 
 
497 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  28.42 
 
 
489 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  30.77 
 
 
505 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  37.7 
 
 
497 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  29.44 
 
 
478 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  29.5 
 
 
478 aa  195  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  29.44 
 
 
478 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  29.49 
 
 
481 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  29.44 
 
 
478 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  28.14 
 
 
486 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2097  hypothetical protein  32.16 
 
 
525 aa  193  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  29.35 
 
 
494 aa  193  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  36.06 
 
 
498 aa  193  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  30.41 
 
 
494 aa  193  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  29.1 
 
 
481 aa  193  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  37.14 
 
 
496 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  28.35 
 
 
489 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  31.94 
 
 
484 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  31.11 
 
 
517 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  29.01 
 
 
486 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  28.71 
 
 
481 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1627  hypothetical protein  37.9 
 
 
521 aa  191  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248376  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2185  hypothetical protein  31.06 
 
 
525 aa  190  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  29.08 
 
 
478 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>