69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44200 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44200  heat shock factor, DNA-binding  100 
 
 
457 aa  943    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.106256  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45112  predicted protein  29.44 
 
 
429 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.146161  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34724  predicted protein  29.01 
 
 
381 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.354987  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44029  predicted protein  28.04 
 
 
460 aa  141  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.492048  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33380  predicted protein  28.43 
 
 
456 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113495  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33622  predicted protein  54.46 
 
 
295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42824  predicted protein  34.48 
 
 
460 aa  117  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.138741  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00120  heat shock transcription factor 2, putative  37.62 
 
 
783 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000900604  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47181  predicted protein  33.9 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42714  predicted protein  33.83 
 
 
580 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  28.96 
 
 
558 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03130  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66106  Protein with similarity to DNA-binding region of heat shock transcription factors  28.41 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.415841  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01750  transcription factor, putative  44.19 
 
 
1028 aa  77.4  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_8561  predicted protein  41.49 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_16323  Heat shock transcription factor  36.79 
 
 
599 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.173191  normal  0.0871257 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45393  predicted protein  38.2 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00000938939  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08035  hypothetical protein similar to heat shock transcription factor 2 (Broad)  34.51 
 
 
798 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.747399 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50621  predicted protein  34.04 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774573  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45389  predicted protein  33.68 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0399784  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39786  predicted protein  30.57 
 
 
352 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45206  predicted protein  32.22 
 
 
538 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0786919  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45392  predicted protein  35.96 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0032411  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50622  predicted protein  35.79 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110965  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44099  heat shock factor, DNA-binding  34.83 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52958  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45391  predicted protein  35.79 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00816165  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45816  predicted protein  33.01 
 
 
690 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49136  predicted protein  31.58 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44917  predicted protein  35.42 
 
 
429 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48325  predicted protein  30 
 
 
670 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43364  predicted protein  36.27 
 
 
285 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49147  predicted protein  33.67 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0401569  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39785  predicted protein  30.51 
 
 
320 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48702  predicted protein  32.48 
 
 
398 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48361  predicted protein  34.34 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_55070  DNA-binding heat shock factor  33 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000184897  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49557  predicted protein  33.05 
 
 
400 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899622  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48572  predicted protein  34.91 
 
 
339 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253588  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44586  predicted protein  33.33 
 
 
344 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  32 
 
 
1106 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48394  predicted protein  27.46 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38294  predicted protein  46.67 
 
 
384 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45666  predicted protein  44.78 
 
 
551 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34415  predicted protein  30.71 
 
 
387 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68146  putative transcription factor  30.58 
 
 
921 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.800099  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49594  predicted protein  33.33 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.853925  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43363  predicted protein  31.11 
 
 
367 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43051  predicted protein  30.77 
 
 
249 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48667  predicted protein  31.76 
 
 
373 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.236073  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49566  predicted protein  29.52 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.088371  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49567  predicted protein  32.23 
 
 
345 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.157197  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47360  predicted protein  29.76 
 
 
454 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31764  predicted protein  26.88 
 
 
548 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48558  predicted protein  25.62 
 
 
468 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39794  predicted protein  32.69 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35419  predicted protein  37.5 
 
 
496 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50136  predicted protein  32.18 
 
 
374 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49596  predicted protein  32.69 
 
 
333 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000230021  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43413  predicted protein  27.96 
 
 
276 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515981  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49620  predicted protein  33.33 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05180  hypothetical protein  35.42 
 
 
803 aa  47.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55108  heat shock factor  29.79 
 
 
718 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260689  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66881  heat-shock related protein  28.71 
 
 
666 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531798  normal  0.0646148 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40994  predicted protein  26.52 
 
 
463 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.236316  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37052  predicted protein  34 
 
 
159 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06998  flocculation suppression protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04502)  47.5 
 
 
523 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893632  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45559  predicted protein  40 
 
 
357 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44750  predicted protein  38.46 
 
 
379 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112014  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42514  predicted protein  34.92 
 
 
256 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>