46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55108 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_55108  heat shock factor  100 
 
 
718 aa  1482    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260689  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44088  predicted protein  39.81 
 
 
583 aa  81.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_55073  predicted protein  71.11 
 
 
934 aa  77  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49147  predicted protein  41.43 
 
 
366 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0401569  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42824  predicted protein  31.62 
 
 
460 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.138741  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47181  predicted protein  33.01 
 
 
515 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48558  predicted protein  39.76 
 
 
468 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42714  predicted protein  38.1 
 
 
580 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43051  predicted protein  29.61 
 
 
249 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45816  predicted protein  38.81 
 
 
690 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44917  predicted protein  35.82 
 
 
429 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66106  Protein with similarity to DNA-binding region of heat shock transcription factors  35.78 
 
 
421 aa  52.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.415841  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33622  predicted protein  27.46 
 
 
295 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  35.37 
 
 
1106 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_16323  Heat shock transcription factor  35.23 
 
 
599 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.173191  normal  0.0871257 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  36.14 
 
 
558 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44586  predicted protein  33.33 
 
 
344 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50136  predicted protein  31.25 
 
 
374 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50481  predicted protein  28.81 
 
 
309 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49566  predicted protein  34.57 
 
 
424 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.088371  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44029  predicted protein  34.78 
 
 
460 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.492048  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49620  predicted protein  28.03 
 
 
280 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39785  predicted protein  35.29 
 
 
320 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48394  predicted protein  27.04 
 
 
448 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50621  predicted protein  34.38 
 
 
420 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774573  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35419  predicted protein  31.03 
 
 
496 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34415  predicted protein  31.25 
 
 
387 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00120  heat shock transcription factor 2, putative  40.82 
 
 
783 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000900604  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43364  predicted protein  36.23 
 
 
285 aa  47.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01750  transcription factor, putative  34.57 
 
 
1028 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49136  predicted protein  35.29 
 
 
433 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49557  predicted protein  32.1 
 
 
400 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899622  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34724  predicted protein  39.66 
 
 
381 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.354987  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48572  predicted protein  36.23 
 
 
339 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253588  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48667  predicted protein  36.62 
 
 
373 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.236073  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40994  predicted protein  34.52 
 
 
463 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.236316  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49596  predicted protein  35.29 
 
 
333 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000230021  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_55070  DNA-binding heat shock factor  27.42 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000184897  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08035  hypothetical protein similar to heat shock transcription factor 2 (Broad)  38 
 
 
798 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.747399 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48361  predicted protein  33.82 
 
 
454 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45112  predicted protein  35.8 
 
 
429 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.146161  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45389  predicted protein  36.99 
 
 
417 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0399784  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45206  predicted protein  31.34 
 
 
538 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0786919  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43363  predicted protein  34.29 
 
 
367 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48702  predicted protein  30.49 
 
 
398 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44099  heat shock factor, DNA-binding  33.78 
 
 
428 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>