187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17304 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17304  predicted protein  100 
 
 		 429 aa  892    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.052839  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04404  methionine aminopeptidase, type II, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00410)  56.48 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48274  predicted protein  58.99 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02860  hypothetical protein  51.66 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31342  predicted protein  52.39 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00369  methionine aminopeptidase, type II, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01750)  47.81 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285783  normal  0.444131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0870  methionine aminopeptidase  33.64 
 
 		 295 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317643  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0755  methionine aminopeptidase  34.24 
 
 		 295 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1229  methionine aminopeptidase  30.72 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0134  methionine aminopeptidase  31.02 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0689  methionine aminopeptidase  31.31 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0165  methionine aminopeptidase  30.18 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00223566  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2126  methionine aminopeptidase  30.48 
 
 		 297 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.110507  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2090  methionine aminopeptidase  31 
 
 		 293 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0487  methionine aminopeptidase  31.56 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0754  methionine aminopeptidase, type II  28.85 
 
 		 287 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.326379  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1620  methionine aminopeptidase  32.18 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1074  methionine aminopeptidase, type II  27.81 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0688841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2584  methionine aminopeptidase  29.56 
 
 		 291 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0656  methionine aminopeptidase  28.18 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.220482  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1051  methionine aminopeptidase  28.01 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0178162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0601  methionine aminopeptidase  29.65 
 
 		 297 aa  123  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0680  methionine aminopeptidase  28.94 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1267  methionine aminopeptidase  27.74 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.531507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1013  methionine aminopeptidase  28.25 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.300955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0071  methionine aminopeptidase  27.86 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186393  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1322  methionine aminopeptidase  27.73 
 
 		 291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1316  methionine aminopeptidase  28.62 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0549  methionine aminopeptidase, type II  28.53 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0959  methionine aminopeptidase  26.95 
 
 		 291 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.99417 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2942  methionine aminopeptidase, type II  26.06 
 
 		 299 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2339  methionine aminopeptidase  27.86 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1509  methionine aminopeptidase  27.47 
 
 		 297 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2052  methionine aminopeptidase  26.75 
 
 		 302 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29217  predicted protein  24.28 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28526  predicted protein  24.29 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00750  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.335958  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67940  Curved DNA-binding protein (42 kDa protein)  22.51 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07299  curved DNA-binding protein (42 kDa protein) (AFU_orthologue; AFUA_2G16820)  22.06 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336171  normal  0.145965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  27.8 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  27.1 
 
 		 250 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  30.73 
 
 		 254 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  25.45 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  25.11 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  25.45 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1048  methionine aminopeptidase, type I  25.82 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  27.62 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1516  methionine aminopeptidase  27.54 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  27.72 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  29.56 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  29.74 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3684  methionine aminopeptidase, type I  30.72 
 
 		 270 aa  57  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0454054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  27.1 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1437  methionine aminopeptidase, type I  29.33 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000252136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1258  methionine aminopeptidase, type I  27.57 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  hitchhiker  0.00735984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  30.32 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  24.05 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  28.26 
 
 		 255 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  29.17 
 
 		 266 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  27.32 
 
 		 248 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  25.12 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  27.85 
 
 		 259 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  29.22 
 
 		 259 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  26.36 
 
 		 265 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  26.19 
 
 		 256 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  28.74 
 
 		 236 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  26.89 
 
 		 263 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 		 271 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  28.96 
 
 		 248 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  23.08 
 
 		 249 aa  53.9  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  27.23 
 
 		 270 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  24.09 
 
 		 274 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  25.89 
 
 		 262 aa  53.1  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  25.11 
 
 		 256 aa  53.1  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  23.85 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  30.43 
 
 		 255 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  26.42 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  25.24 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  27.35 
 
 		 254 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  25.23 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  24.42 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  24.07 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  28.45 
 
 		 274 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  26.09 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  25.47 
 
 		 260 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0846  methionine aminopeptidase  25.36 
 
 		 286 aa  51.2  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  27.44 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  24.07 
 
 		 255 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  28.11 
 
 		 248 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  28.48 
 
 		 236 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  26.64 
 
 		 265 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  24.54 
 
 		 264 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  23.9 
 
 		 263 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  24.58 
 
 		 271 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  22.57 
 
 		 274 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  26.15 
 
 		 250 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0631  methionine aminopeptidase  25.39 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0700  methionine aminopeptidase  26.7 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  23.94 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  24.55 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>