More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31342 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31342  predicted protein  100 
 
 
343 aa  716    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04404  methionine aminopeptidase, type II, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00410)  59.54 
 
 
448 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02860  hypothetical protein  57.55 
 
 
444 aa  390  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17304  predicted protein  52.39 
 
 
429 aa  372  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.052839  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00369  methionine aminopeptidase, type II, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01750)  53.18 
 
 
458 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285783  normal  0.444131 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48274  predicted protein  55.16 
 
 
415 aa  358  6e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0134  methionine aminopeptidase  32.81 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0755  methionine aminopeptidase  34.29 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0689  methionine aminopeptidase  32.4 
 
 
300 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.827876  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1229  methionine aminopeptidase  32.19 
 
 
299 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0870  methionine aminopeptidase  32.69 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0165  methionine aminopeptidase  31.1 
 
 
304 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00223566  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0487  methionine aminopeptidase  31.56 
 
 
294 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2126  methionine aminopeptidase  30.54 
 
 
297 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.110507  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0754  methionine aminopeptidase, type II  31.39 
 
 
287 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.326379  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2339  methionine aminopeptidase  31.13 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2090  methionine aminopeptidase  30.77 
 
 
293 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0656  methionine aminopeptidase  29.45 
 
 
287 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.220482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1620  methionine aminopeptidase  31.83 
 
 
297 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0601  methionine aminopeptidase  28.9 
 
 
297 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0680  methionine aminopeptidase  29.84 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2584  methionine aminopeptidase  29.57 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0071  methionine aminopeptidase  29.39 
 
 
319 aa  133  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0549  methionine aminopeptidase, type II  31.03 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1267  methionine aminopeptidase  28.53 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.531507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1316  methionine aminopeptidase  32.38 
 
 
296 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1074  methionine aminopeptidase, type II  27.76 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0688841  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2942  methionine aminopeptidase, type II  28.8 
 
 
299 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1509  methionine aminopeptidase  30.35 
 
 
297 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1051  methionine aminopeptidase  27.33 
 
 
291 aa  122  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0178162 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1322  methionine aminopeptidase  27.85 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0959  methionine aminopeptidase  30.68 
 
 
291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99417 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2052  methionine aminopeptidase  30.06 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1013  methionine aminopeptidase  28.14 
 
 
291 aa  116  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.300955  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28526  predicted protein  23.77 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  26.09 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29217  predicted protein  21.35 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  30.33 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  25.81 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  28.25 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  28.57 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  30.77 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  26.79 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  28.38 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  26.4 
 
 
250 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1437  methionine aminopeptidase, type I  29.41 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000252136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  31.1 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  24.64 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  29.44 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  26.85 
 
 
261 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  26.19 
 
 
249 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  25.87 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  25.47 
 
 
270 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1471  methionine aminopeptidase, type I  25.94 
 
 
258 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  24.88 
 
 
249 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  24.88 
 
 
249 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  26.22 
 
 
289 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1756  methionine aminopeptidase  27.62 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0318499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  25.47 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  27.64 
 
 
257 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  26.6 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  25.7 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  23.5 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  25.62 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  24.44 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  24.4 
 
 
249 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  25.78 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  23.5 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  24.37 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  27.62 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  23.7 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  23.7 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  26.17 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  23.22 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 
250 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  23.7 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  24.44 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1336  methionine aminopeptidase, type I  26.37 
 
 
256 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  23.7 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  25.71 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  23.71 
 
 
279 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2597  methionine aminopeptidase type I  24.17 
 
 
263 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.156772  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  24.77 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  23.33 
 
 
250 aa  57  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  23.81 
 
 
274 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  24.54 
 
 
279 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  26.07 
 
 
265 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  25.87 
 
 
258 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  24.11 
 
 
249 aa  55.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  24.88 
 
 
253 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  24.88 
 
 
253 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  27.06 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  25.36 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  27.5 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  23.36 
 
 
274 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  23.94 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24514  predicted protein  25.49 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.63338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  24.77 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  22.13 
 
 
273 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  25.81 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>