124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67940 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_67940  Curved DNA-binding protein (42 kDa protein)  100 
 
 
383 aa  783    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00750  conserved hypothetical protein  38.72 
 
 
388 aa  246  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.335958  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07299  curved DNA-binding protein (42 kDa protein) (AFU_orthologue; AFUA_2G16820)  37.01 
 
 
403 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336171  normal  0.145965 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28526  predicted protein  35.16 
 
 
379 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29217  predicted protein  31.51 
 
 
406 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1051  methionine aminopeptidase  25.08 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0178162 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65920  predicted protein  33.33 
 
 
576 aa  77  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1322  methionine aminopeptidase  27.86 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04404  methionine aminopeptidase, type II, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00410)  24.48 
 
 
448 aa  72.8  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2090  methionine aminopeptidase  22.36 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0959  methionine aminopeptidase  23.77 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99417 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17304  predicted protein  23.05 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.052839  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0680  methionine aminopeptidase  22.15 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1013  methionine aminopeptidase  26.89 
 
 
291 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.300955  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2584  methionine aminopeptidase  21.59 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0754  methionine aminopeptidase, type II  24.1 
 
 
287 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.326379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0165  methionine aminopeptidase  23.53 
 
 
304 aa  59.7  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00223566  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  24 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  24.33 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0487  methionine aminopeptidase  22.59 
 
 
294 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0240  methionine aminopeptidase  25.26 
 
 
291 aa  56.2  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  23.87 
 
 
257 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  25.81 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0689  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
300 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.827876  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  25.81 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  25.64 
 
 
254 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0134  methionine aminopeptidase  21.66 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 
268 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  22.95 
 
 
265 aa  53.1  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  23 
 
 
271 aa  53.5  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  26.19 
 
 
275 aa  53.5  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  24.43 
 
 
268 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  22.4 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2339  methionine aminopeptidase  23.03 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  25.7 
 
 
259 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  22.99 
 
 
253 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  22.75 
 
 
253 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  25.14 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  24.43 
 
 
268 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0601  methionine aminopeptidase  21.7 
 
 
297 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  25.97 
 
 
249 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0071  methionine aminopeptidase  22.33 
 
 
319 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  25.97 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  24.18 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  24.34 
 
 
253 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  27.47 
 
 
256 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0755  methionine aminopeptidase  22.03 
 
 
295 aa  50.4  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1229  methionine aminopeptidase  21.02 
 
 
299 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  22.4 
 
 
269 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  22.4 
 
 
269 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  24.34 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  24 
 
 
274 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0549  methionine aminopeptidase, type II  22.01 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1267  methionine aminopeptidase  22.12 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.531507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  24.34 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48274  predicted protein  21.64 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00369  methionine aminopeptidase, type II, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01750)  25 
 
 
458 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285783  normal  0.444131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  25.48 
 
 
280 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  23.76 
 
 
248 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1620  methionine aminopeptidase  22.01 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  23.91 
 
 
258 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2126  methionine aminopeptidase  21.56 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.110507  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0870  methionine aminopeptidase  21.55 
 
 
295 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  22.05 
 
 
253 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2753  methionine aminopeptidase, type I  21.71 
 
 
254 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  22.35 
 
 
262 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2942  methionine aminopeptidase, type II  22.19 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  25.27 
 
 
236 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0656  methionine aminopeptidase  21.23 
 
 
287 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.220482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  26.9 
 
 
268 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  26.9 
 
 
268 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  26.9 
 
 
268 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  21.59 
 
 
261 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  26.9 
 
 
268 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  25.15 
 
 
265 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  26.32 
 
 
266 aa  46.2  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  21.54 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  20.94 
 
 
253 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  29.41 
 
 
274 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  25.67 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  20.94 
 
 
253 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  25.67 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  22.63 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  28.93 
 
 
250 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  23.46 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  21.14 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  23.46 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  27.05 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  22.86 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  23.46 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  23.46 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  23.46 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  23.46 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  23.46 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  26.32 
 
 
278 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  23.26 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  20.72 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  23.76 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>