More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11281 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11281  predicted protein  100 
 
 
169 aa  349  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.372672  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  62.09 
 
 
227 aa  200  9e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72675  guanylate kinase (GUK1)  56.71 
 
 
193 aa  194  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12779  normal  0.729563 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10188  hypothetical protein similar to guanylate kinase (Broad)  52.87 
 
 
228 aa  175  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_006686  CND04800  guanylate kinase, putative  50 
 
 
217 aa  159  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.580841  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11131  predicted protein  45.71 
 
 
207 aa  154  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  50.98 
 
 
201 aa  151  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  49.02 
 
 
183 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  45.91 
 
 
206 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  48.37 
 
 
216 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  48.37 
 
 
216 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  48.34 
 
 
207 aa  148  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  45.91 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  46.41 
 
 
202 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  45.34 
 
 
192 aa  142  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  47.5 
 
 
197 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  46.36 
 
 
194 aa  140  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  45.1 
 
 
200 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  45.33 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  45.7 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  46.25 
 
 
205 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  45.62 
 
 
204 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  46.25 
 
 
210 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  41.67 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  45.16 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  45.16 
 
 
198 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  45.16 
 
 
198 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  44.08 
 
 
199 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  41.88 
 
 
202 aa  134  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  41.94 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  44.08 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  43.02 
 
 
218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  44.44 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  43.4 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  44.65 
 
 
206 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  43.4 
 
 
207 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  42.11 
 
 
185 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  42.76 
 
 
205 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  45 
 
 
207 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  45.03 
 
 
233 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  41.77 
 
 
184 aa  131  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  44.44 
 
 
212 aa  131  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  41.88 
 
 
207 aa  131  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  41.88 
 
 
207 aa  131  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  42.77 
 
 
207 aa  131  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  44.03 
 
 
206 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  43.64 
 
 
207 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  41.88 
 
 
207 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  42.14 
 
 
207 aa  130  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  42.5 
 
 
212 aa  130  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  41.14 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  44.03 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  43.75 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  41.51 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  45.33 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  44.38 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  42.14 
 
 
202 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  44.44 
 
 
195 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  45.33 
 
 
189 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  42.14 
 
 
203 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  42.77 
 
 
210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  42.77 
 
 
210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  44.23 
 
 
209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  42.77 
 
 
210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  42.14 
 
 
207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  41.29 
 
 
213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  42.14 
 
 
224 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  42.14 
 
 
207 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  42.14 
 
 
207 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  40 
 
 
212 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  46.05 
 
 
217 aa  127  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  42.14 
 
 
207 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  42.14 
 
 
207 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  42.14 
 
 
207 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  39.87 
 
 
184 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  42.48 
 
 
207 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  44.38 
 
 
204 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  42.14 
 
 
224 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  42.14 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  42.5 
 
 
198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  41.29 
 
 
212 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  40.88 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  46 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  40.88 
 
 
207 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  42.77 
 
 
207 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  41.51 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  42.77 
 
 
209 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  43.59 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  42.48 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  42.11 
 
 
207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  42.14 
 
 
229 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  40.88 
 
 
202 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>