More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11131 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11131  predicted protein  100 
 
 
207 aa  430  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72675  guanylate kinase (GUK1)  40.1 
 
 
193 aa  158  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12779  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  42.79 
 
 
227 aa  154  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11281  predicted protein  45.71 
 
 
169 aa  154  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.372672  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10188  hypothetical protein similar to guanylate kinase (Broad)  36.45 
 
 
228 aa  145  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  41.21 
 
 
207 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_006686  CND04800  guanylate kinase, putative  38.89 
 
 
217 aa  141  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.580841  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  40.41 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  39.8 
 
 
212 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  38.31 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  41.29 
 
 
207 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  38.5 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  38.31 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  37.81 
 
 
210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  37.81 
 
 
210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  37.37 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  37.37 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  37.81 
 
 
210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  131  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  36.82 
 
 
207 aa  131  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  37.31 
 
 
210 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  38.24 
 
 
215 aa  131  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  38.31 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  37.81 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  37.31 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  37.81 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  37.19 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  37.81 
 
 
207 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  38.92 
 
 
194 aa  128  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.282119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  39.8 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  36.95 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  37.5 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  36.32 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  38.42 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  36.63 
 
 
207 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  37.5 
 
 
207 aa  125  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  39.3 
 
 
207 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  37.13 
 
 
213 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  38.31 
 
 
207 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  36.27 
 
 
198 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  37.44 
 
 
203 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  37.5 
 
 
207 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  35 
 
 
183 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  38.02 
 
 
207 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  38.02 
 
 
207 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  38.5 
 
 
229 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  38 
 
 
207 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  35.68 
 
 
206 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  35.5 
 
 
200 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  36.63 
 
 
192 aa  121  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  35.5 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  37.13 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1796  guanylate kinase  37.11 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  38.27 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  39.3 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  38.31 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  37.13 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  35.71 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  37.13 
 
 
209 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  38.81 
 
 
225 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  37.76 
 
 
215 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  34.5 
 
 
207 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  35.82 
 
 
210 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  36.82 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  38.81 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  35.47 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  37.81 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  38.31 
 
 
225 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  35.32 
 
 
210 aa  118  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  38 
 
 
217 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  35.78 
 
 
218 aa  118  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  36 
 
 
207 aa  118  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  36 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  35.32 
 
 
220 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  35 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  38 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  37.82 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1311  guanylate kinase  35.57 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1192  guanylate kinase  35.57 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  35.15 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  35.05 
 
 
184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  36 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  36.22 
 
 
210 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  38.54 
 
 
219 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  35.2 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  34.83 
 
 
212 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2284  guanylate kinase  36.82 
 
 
242 aa  115  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.429726  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  35.32 
 
 
202 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>