More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4984 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4984  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 
472 aa  924    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.74 
 
 
478 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  42.86 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1194  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  40.04 
 
 
476 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  33.61 
 
 
492 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  33.06 
 
 
492 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  33.06 
 
 
492 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  33.06 
 
 
492 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  33.06 
 
 
492 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  33.06 
 
 
492 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  32.28 
 
 
497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  32.91 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  32.65 
 
 
492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  32.85 
 
 
492 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  33.95 
 
 
496 aa  213  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  31.33 
 
 
518 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  32.32 
 
 
492 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  32.65 
 
 
488 aa  206  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  31.75 
 
 
492 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  31.53 
 
 
484 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  31.53 
 
 
492 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  31.53 
 
 
492 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  31.39 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  31.75 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  30.04 
 
 
496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  31.75 
 
 
493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  31.24 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  31.75 
 
 
493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  31.75 
 
 
493 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  31.75 
 
 
492 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  31.53 
 
 
492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  31.24 
 
 
486 aa  200  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  31.32 
 
 
487 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  32.25 
 
 
493 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  32.02 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  33.19 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  32.48 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  31.78 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  32.93 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  31.19 
 
 
492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  31.82 
 
 
513 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  30.8 
 
 
492 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  31.43 
 
 
489 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  30.25 
 
 
483 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  30.02 
 
 
483 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  31.22 
 
 
489 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  31.01 
 
 
489 aa  192  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  32.61 
 
 
499 aa  190  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  30.04 
 
 
493 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  28.12 
 
 
492 aa  186  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  29.96 
 
 
486 aa  186  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  29.68 
 
 
492 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  29.68 
 
 
492 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  29.05 
 
 
499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  31.51 
 
 
488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  29.47 
 
 
492 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  29.68 
 
 
483 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  31.96 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  30.57 
 
 
483 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  30.15 
 
 
498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  29.75 
 
 
491 aa  183  6e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  30.63 
 
 
497 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  30.04 
 
 
494 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  30.85 
 
 
496 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  30.04 
 
 
483 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  29.65 
 
 
482 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  29.18 
 
 
483 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  29.18 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  29.68 
 
 
492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  29.18 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  29.82 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  29.18 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  32.4 
 
 
498 aa  181  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  29.91 
 
 
506 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  30.48 
 
 
495 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  30.55 
 
 
504 aa  178  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  30.61 
 
 
495 aa  178  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  28.54 
 
 
482 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  31.06 
 
 
496 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  28.78 
 
 
493 aa  177  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  28.95 
 
 
528 aa  177  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  29.69 
 
 
506 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  30.28 
 
 
495 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  30.71 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  28.34 
 
 
536 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  31.17 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  29.81 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.18 
 
 
512 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.18 
 
 
512 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  29.49 
 
 
495 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  29.74 
 
 
519 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  28.68 
 
 
541 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  29.76 
 
 
494 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  29.34 
 
 
499 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  29.55 
 
 
494 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  29.73 
 
 
511 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  28.57 
 
 
497 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  28.39 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  29.89 
 
 
494 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  29.89 
 
 
494 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>