More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0570 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0570  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
338 aa  701    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.714449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 
341 aa  315  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.36 
 
 
345 aa  278  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.27 
 
 
345 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.44 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.64 
 
 
332 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  42.14 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.36 
 
 
337 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  44.02 
 
 
340 aa  268  8e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.64 
 
 
337 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.14 
 
 
332 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.86 
 
 
344 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
337 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
341 aa  266  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.89 
 
 
342 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  40.41 
 
 
343 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  44.01 
 
 
336 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
338 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.49 
 
 
338 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
342 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.03 
 
 
344 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.14 
 
 
332 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
338 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 
336 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.66 
 
 
338 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.84 
 
 
332 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.14 
 
 
332 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.14 
 
 
332 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.14 
 
 
332 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.14 
 
 
332 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
339 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
338 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.14 
 
 
332 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
332 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
332 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 
346 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
349 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
339 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 
338 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  40.17 
 
 
344 aa  256  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.77 
 
 
345 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.2 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.48 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  40.48 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.48 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  40.48 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.48 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.06 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  40.41 
 
 
339 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  37.43 
 
 
345 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 
339 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  37.43 
 
 
345 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  40.12 
 
 
345 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  37.71 
 
 
345 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  37.71 
 
 
345 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  37.43 
 
 
345 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
354 aa  250  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  41.4 
 
 
345 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
332 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.88 
 
 
345 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.58 
 
 
345 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
333 aa  246  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
333 aa  246  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.3 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.84 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
338 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 
333 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.04 
 
 
341 aa  242  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.77 
 
 
341 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.91 
 
 
333 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.17 
 
 
335 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  39.76 
 
 
348 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.82 
 
 
340 aa  240  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  40.29 
 
 
347 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.57 
 
 
334 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
332 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
345 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
345 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
345 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
345 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.86 
 
 
345 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4367  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.54 
 
 
344 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
332 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1778  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.86 
 
 
345 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1691  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.56 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.415717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  38.14 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.72 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.4 
 
 
334 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  38.26 
 
 
342 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  35.4 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.99 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
333 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  37.98 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>