200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_60120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  61.58 
 
 
184 aa  230  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.68 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0746  deoxycytidine triphosphate deaminase (dcD-2)  30.41 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0671531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  27.22 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.36 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  28.99 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  28.39 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.38 
 
 
176 aa  61.6  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  29.5 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  28.47 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0554  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.61 
 
 
141 aa  61.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.059854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  28.47 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.41 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.91 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.12 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  27.74 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1372  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  28.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0239095  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.43 
 
 
197 aa  57.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  31.46 
 
 
143 aa  57.8  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.43 
 
 
193 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  26.83 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.11 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.43 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  29.63 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  26.99 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.61 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  26.99 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.58 
 
 
192 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  30.66 
 
 
157 aa  54.7  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.58 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3384  dUTP diphosphatase  31.78 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.36 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.09 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.12 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1529  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.46 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.19 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  26.12 
 
 
171 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0123121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  30 
 
 
200 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.7 
 
 
191 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.21 
 
 
172 aa  52  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07970  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  32.63 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.4 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1801  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  32.69 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.18 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.6 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.7 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0596  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  30.5 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382829  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0142  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  35.23 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0643266  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.35 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.89 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1337  dUTP diphosphatase  29.46 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.18 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.41 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.59 
 
 
203 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.78 
 
 
195 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1588  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.21 
 
 
191 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.7 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0296  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.53 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.25 
 
 
147 aa  48.5  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.12 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1425  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.21 
 
 
191 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.703083  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.31 
 
 
191 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.12 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  28.57 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11124  dUTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14580)  28.44 
 
 
131 aa  47.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.73 
 
 
199 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 
191 aa  47.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.82 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  30 
 
 
196 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.27 
 
 
191 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0395  2-deoxycytidine 5-triphosphate deaminase  29.7 
 
 
193 aa  47  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.610625  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.35 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.71 
 
 
180 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1595  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  32.58 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0707  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.51 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.42 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.71 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3839  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  35.23 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000206346  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1700  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.21 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000175213  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19090  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.9 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.62 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  28.85 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1646  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.9 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.87 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.12 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.64 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.27 
 
 
186 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>