More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0525 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0554  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.52 
 
 
141 aa  188  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.059854  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  59.31 
 
 
145 aa  180  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  51.72 
 
 
145 aa  156  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  53.42 
 
 
143 aa  155  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  31.03 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.98 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.18 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1529  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.21 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  28.16 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.68 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.11 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.75 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.03 
 
 
196 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.49 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.57 
 
 
191 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1979  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase (dut)  23.23 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.15 
 
 
195 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 
194 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  26.88 
 
 
191 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.92 
 
 
176 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.11 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.11 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.46 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3028  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  31.25 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.502701  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7646  predicted protein  35.87 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.305343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.12 
 
 
211 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.58 
 
 
216 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.09 
 
 
199 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.74 
 
 
193 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.95 
 
 
193 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.49 
 
 
191 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.99 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.42 
 
 
195 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.96 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.48 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.81 
 
 
194 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.58 
 
 
171 aa  57.4  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.44 
 
 
191 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.78 
 
 
190 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13120  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  36.84 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00106773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.35 
 
 
197 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.57 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.57 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.88 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.47 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.7 
 
 
194 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1636  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  28.12 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.485078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  31.25 
 
 
177 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.86 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.48 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.79 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07970  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  27.78 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.01 
 
 
190 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.01 
 
 
190 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.01 
 
 
190 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.53 
 
 
193 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.81 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  26.35 
 
 
193 aa  53.9  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.34 
 
 
191 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  30.95 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1147  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  31.31 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 
198 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.33 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.82 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  32.91 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.81 
 
 
192 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.03 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.17 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.29 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  30.95 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  31.18 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.79 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  30.95 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3962  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  33.33 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000806125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0730  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  28.44 
 
 
145 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2348  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  29.46 
 
 
160 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24260  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  30.93 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0957  deoxyuridine 5'triphosphate nucleotidohydrolase  26.89 
 
 
149 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1937  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  33.68 
 
 
177 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.82 
 
 
193 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2467  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  32.63 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.82 
 
 
191 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0156  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  35.05 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.134512  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0767  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  30.53 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.296419  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.31 
 
 
183 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0065  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  35.05 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000347676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.28 
 
 
193 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0381  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  33.33 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.06 
 
 
194 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.59 
 
 
194 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.25 
 
 
194 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3849  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  35.05 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4141  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  35.05 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3948  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  34.02 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5010  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  35.05 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00138918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>