56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0328 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  100 
 
 
156 aa  321  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  98.08 
 
 
156 aa  315  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  97.44 
 
 
156 aa  313  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  87.82 
 
 
156 aa  286  6e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1372  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  58.33 
 
 
160 aa  200  8e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0239095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  40.71 
 
 
177 aa  99.8  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  42.18 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0123121 
 
 
-
 
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  38.46 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  38.46 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  38.46 
 
 
170 aa  94  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  40.97 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  38.19 
 
 
157 aa  87.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1801  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  37.06 
 
 
179 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  38.69 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11124  dUTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14580)  37.82 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0596  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  35.53 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382829  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1337  dUTP diphosphatase  34.46 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3384  dUTP diphosphatase  30.63 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  28.47 
 
 
177 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.53 
 
 
191 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  26.8 
 
 
184 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.06 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.97 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.77 
 
 
201 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.71 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.53 
 
 
194 aa  51.2  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.69 
 
 
199 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.06 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.56 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.26 
 
 
192 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.2 
 
 
211 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.56 
 
 
190 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.6 
 
 
196 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.2 
 
 
190 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  24 
 
 
190 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  24 
 
 
190 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  24 
 
 
190 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.24 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  24 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  24 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.92 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.19 
 
 
195 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.39 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.95 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07970  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  37.97 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1017  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  26.21 
 
 
386 aa  44.3  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286027 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.81 
 
 
201 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.26 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.87 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0744  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.81 
 
 
182 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00363492  hitchhiker  0.00401854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1871  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  30.09 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.54 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  21.97 
 
 
191 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.19 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  26.83 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.17 
 
 
177 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>