More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2260 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0554  deoxycytidine triphosphate deaminase  58.62 
 
 
141 aa  165  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.059854  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  52.41 
 
 
145 aa  150  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  48.63 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  51.72 
 
 
147 aa  140  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1529  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.84 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  31.61 
 
 
178 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  31.03 
 
 
182 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.79 
 
 
177 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.89 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.27 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  31.89 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.19 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  31.89 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.85 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.81 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.65 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.11 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.65 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.27 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.27 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.19 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.27 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 
197 aa  70.1  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.87 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1197  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.28 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.446806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.59 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.19 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.65 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  30 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.65 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.19 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.57 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.84 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.03 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.16 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.37 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.65 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.65 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.41 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.49 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.1 
 
 
196 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.19 
 
 
193 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.49 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 
190 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.71 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 
190 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.24 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 
190 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.72 
 
 
200 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 
199 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 
201 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.49 
 
 
190 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.41 
 
 
191 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.09 
 
 
194 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.94 
 
 
200 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0957  deoxyuridine 5'triphosphate nucleotidohydrolase  33.06 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.94 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.83 
 
 
187 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.04 
 
 
195 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1042  deoxyuridine 5'triphosphate nucleotidohydrolase  38.95 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00593592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.41 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 
211 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28197  predicted protein  30.3 
 
 
155 aa  58.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 
192 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.95 
 
 
185 aa  57.8  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.4 
 
 
196 aa  57.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0744  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.31 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00363492  hitchhiker  0.00401854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.45 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1970  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  39.78 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.205532 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69362  Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase) (dUTP pyrophosphatase)  31.52 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0461535  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  32.26 
 
 
195 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0147  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  31.37 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0780746  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.41 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 
193 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  32.61 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03550  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  31 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 
186 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1063  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  31 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.38 
 
 
186 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.5 
 
 
194 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3841  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  36 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691801  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3028  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  34.38 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.502701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.71 
 
 
185 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  32 
 
 
184 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.3 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.3 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3554  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  36.19 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605324  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1147  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  33.33 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.35 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.67 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10830  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  32 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000940955  unclonable  0.00000000135122 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0720  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  33.04 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000524233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1636  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  33.01 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.485078  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0019  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  32.69 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.73 
 
 
183 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.37 
 
 
193 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>