152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1197 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1197  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
153 aa  313  7e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.446806  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  31.76 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.28 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.55 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.89 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  29.89 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.58 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.4 
 
 
196 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  29.31 
 
 
191 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.89 
 
 
196 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.38 
 
 
194 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.81 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.16 
 
 
194 aa  60.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0554  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.28 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.059854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.29 
 
 
191 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  28.31 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.65 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.16 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.16 
 
 
192 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.74 
 
 
191 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.86 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.44 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.21 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0744  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.21 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00363492  hitchhiker  0.00401854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1529  deoxycytidine triphosphate deaminase  32 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.19 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.14 
 
 
191 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.14 
 
 
194 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.44 
 
 
192 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 
201 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 
192 aa  53.9  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  28 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  28 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1880  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.29 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.57 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 
190 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.14 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.14 
 
 
186 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
186 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.14 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.44 
 
 
196 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.71 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0746  deoxycytidine triphosphate deaminase (dcD-2)  30.99 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0671531  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.43 
 
 
191 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.47 
 
 
176 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.44 
 
 
190 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.44 
 
 
190 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.44 
 
 
216 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.71 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.61 
 
 
190 aa  50.4  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0309  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.37 
 
 
190 aa  50.4  0.000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.620462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.59 
 
 
193 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.73 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.14 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.59 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1314  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.83 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.17 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.91 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.44 
 
 
191 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.17 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.16 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.35 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2200  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.7 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2366  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
188 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0737  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.74 
 
 
206 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2740  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.71 
 
 
189 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2143  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.66 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.760449  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.09 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3880  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1505  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2755  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0713  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  24.21 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.86 
 
 
211 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.66 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0688  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3293  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0762  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.44 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139183  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1411  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.26 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0577  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.22 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2446  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.78 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02771  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.73 
 
 
197 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.587508  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2175  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.47 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.0718867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0649  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2579  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.47 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425802  normal  0.125537 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0313  deoxycytidine triphosphate deaminase  25 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1877  deoxycytidine triphosphate deaminase  25 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.04 
 
 
196 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1965  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.23 
 
 
189 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0432  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.78 
 
 
184 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1215  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.47 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2987  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.47 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1057  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.47 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>