284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1825 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
176 aa  353  5.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  95.45 
 
 
176 aa  339  1e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  90.34 
 
 
176 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  86.93 
 
 
176 aa  316  1e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.17 
 
 
179 aa  243  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.51 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.82 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.19 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.51 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.12 
 
 
179 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  33.53 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.07 
 
 
199 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.71 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.57 
 
 
186 aa  92  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.79 
 
 
177 aa  90.9  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.22 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0744  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.93 
 
 
182 aa  89  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00363492  hitchhiker  0.00401854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.35 
 
 
195 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.81 
 
 
191 aa  87.8  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.49 
 
 
201 aa  87.4  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.49 
 
 
196 aa  87.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0746  deoxycytidine triphosphate deaminase (dcD-2)  35.76 
 
 
159 aa  87  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0671531  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.77 
 
 
187 aa  87  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
191 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.43 
 
 
201 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.98 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  36.14 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.72 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  32.34 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  27.57 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.86 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.87 
 
 
194 aa  84  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.15 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.63 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.72 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.6 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.11 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.83 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.67 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.61 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.17 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  31.03 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.3 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.1 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2396  deoxycytidine triphosphate deaminase  30 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.181474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.03 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.28 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.52 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.73 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0825  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.42 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.43 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  30 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.21 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1880  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.1 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2200  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.03 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.26 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.73 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1019  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.42 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.267664  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.21 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2579  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.51 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425802  normal  0.125537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1646  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.79 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1100  deoxycytidine triphosphate deaminase  32 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.77 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.17 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1180  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.37 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  32 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1314  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.02 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19090  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.79 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.03 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.77 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1140  deoxycytidine triphosphate deaminase  32 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0341669  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.12 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3478  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.89 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.51 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.73 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1785  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000678653  normal  0.0149108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2755  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.98 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1700  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.12 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000175213  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0990  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.13 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1129  deoxycytidine triphosphate deaminase  32 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.929704  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  25.58 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2660  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2286  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.777685  hitchhiker  0.000350078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4144  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  31.33 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3027  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.1 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2885  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.1 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3883  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.33 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0577  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.46 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2175  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.98 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.0718867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0714  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.95 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1202  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.33 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5764  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.95 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1612  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.95 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00997838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>