292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0140 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.6 
 
 
196 aa  153  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  47.09 
 
 
176 aa  144  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.53 
 
 
172 aa  142  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.82 
 
 
176 aa  140  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.19 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.77 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.19 
 
 
179 aa  135  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.66 
 
 
179 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.46 
 
 
180 aa  101  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  31.25 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.53 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.7 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.67 
 
 
194 aa  87.4  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  31.11 
 
 
191 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.33 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.17 
 
 
186 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.22 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0744  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.09 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00363492  hitchhiker  0.00401854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  33.14 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.97 
 
 
191 aa  84.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.15 
 
 
211 aa  84.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.7 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.42 
 
 
194 aa  84.7  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.7 
 
 
192 aa  84.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
196 aa  84.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.08 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.16 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.07 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.57 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.56 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.16 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.81 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.88 
 
 
196 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
216 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.08 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.6 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.08 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.62 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.32 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.63 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.46 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.12 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.49 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.07 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.67 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.87 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.62 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.62 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.62 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  39.1 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.71 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.26 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  30.34 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1880  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.81 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.02 
 
 
183 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1314  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.62 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2200  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.3 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  35 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.27 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.32 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.42 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.6 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.02 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1100  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0577  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.09 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1140  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0341669  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.42 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1206  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.46 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106779  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4144  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  31.91 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2579  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.85 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425802  normal  0.125537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3883  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.91 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.32 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.51 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.43 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  35 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1129  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.929704  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.83 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.28 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  30.05 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2175  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.85 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.0718867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0649  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.75 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1202  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.78 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0916  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.53 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.579624  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1060  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.53 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.571656  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2755  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1186  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.8 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.73 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  29.34 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3478  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.63 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0688  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1408  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.38 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3293  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.69 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2438  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.22 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00886946  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2433  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.22 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>