More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0075 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  100 
 
 
143 aa  295  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0554  deoxycytidine triphosphate deaminase  52.11 
 
 
141 aa  152  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.059854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.63 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  51.94 
 
 
145 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  53.42 
 
 
147 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
179 aa  93.6  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  32 
 
 
180 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.6 
 
 
196 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.53 
 
 
177 aa  90.1  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  30.99 
 
 
178 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
216 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.6 
 
 
191 aa  87  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  29.24 
 
 
182 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
189 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.43 
 
 
200 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.55 
 
 
183 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.81 
 
 
203 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
191 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.89 
 
 
199 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
190 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
196 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.83 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.49 
 
 
199 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  32.04 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.5 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
191 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.32 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.83 
 
 
191 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.83 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.72 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.48 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1529  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.27 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.43 
 
 
195 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.6 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.94 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.99 
 
 
193 aa  77  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.43 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.58 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1197  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.76 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.446806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.73 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.73 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.24 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.8 
 
 
194 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.02 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.81 
 
 
196 aa  72  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  25 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.18 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  29.28 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.95 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.28 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.83 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.82 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.33 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.58 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.62 
 
 
193 aa  70.5  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.42 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.03 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  28.09 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.73 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.26 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1274  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  39.39 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.0204105 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.81 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.19 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2002  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.36 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169741  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7646  predicted protein  33.64 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.305343  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.16 
 
 
179 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.48 
 
 
193 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.48 
 
 
193 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
193 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
194 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.48 
 
 
194 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1629  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  35.48 
 
 
173 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0730  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  36.17 
 
 
145 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.5 
 
 
193 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.5 
 
 
193 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.5 
 
 
193 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.48 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.78 
 
 
186 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.48 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0612  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.59 
 
 
203 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.48 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2355  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.48 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.430961 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.48 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.417752 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.48 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.42 
 
 
207 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.62 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  33.62 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1636  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  36.56 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0081699  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  25 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>