285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0151 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
172 aa  350  5e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.59 
 
 
196 aa  254  4e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.02 
 
 
176 aa  150  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.82 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.55 
 
 
176 aa  143  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.53 
 
 
171 aa  142  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.89 
 
 
176 aa  141  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  45.76 
 
 
179 aa  135  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.14 
 
 
180 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.84 
 
 
177 aa  107  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  35.93 
 
 
182 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.93 
 
 
179 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  34.12 
 
 
178 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.14 
 
 
194 aa  101  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.07 
 
 
201 aa  95.1  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.52 
 
 
195 aa  92  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.81 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.78 
 
 
185 aa  90.9  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.71 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.52 
 
 
203 aa  89  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  32.04 
 
 
191 aa  89  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.81 
 
 
191 aa  89  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.62 
 
 
199 aa  88.6  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0744  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.52 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00363492  hitchhiker  0.00401854 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.91 
 
 
196 aa  88.2  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.15 
 
 
191 aa  88.2  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.05 
 
 
198 aa  87.8  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0146  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.61 
 
 
184 aa  87.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.07 
 
 
200 aa  87.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
159 aa  87.4  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  29.38 
 
 
206 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2200  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.95 
 
 
186 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.15 
 
 
196 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1507  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.34 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.56 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.28 
 
 
201 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.89 
 
 
191 aa  85.1  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2143  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.93 
 
 
184 aa  84.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.760449  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0762  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.98 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139183  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1247  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.87 
 
 
206 aa  84.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0198775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.77 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.53 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.08 
 
 
193 aa  84.3  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2579  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.49 
 
 
188 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425802  normal  0.125537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.21 
 
 
197 aa  84.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.73 
 
 
190 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.15 
 
 
191 aa  84  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4050  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.98 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.49 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.77 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.28 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.46 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2366  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.03 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1646  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.78 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.17 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.17 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19090  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.78 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.17 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.11 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0671  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.35 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.014238  normal  0.109558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.12 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.77 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.77 
 
 
186 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
192 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19300  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.46 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.83 
 
 
196 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1700  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.12 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000175213  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3880  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.49 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.67 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2175  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.0718867 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  33.52 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2396  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.77 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.181474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1140  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0341669  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1100  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1588  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.25 
 
 
191 aa  80.5  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1425  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.25 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.703083  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1202  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.43 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.69 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1505  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.03 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1408  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.43 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.73 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4144  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  32.43 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3883  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.43 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  31.52 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2755  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.69 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0649  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0688  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.67 
 
 
193 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1129  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.79 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.929704  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.87 
 
 
196 aa  79  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1965  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.03 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.2 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>