240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1100 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1100  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 188 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1140  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 188 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0341669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  99.47 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1129  deoxycytidine triphosphate deaminase  97.34 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.929704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4144  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  96.81 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3883  deoxycytidine triphosphate deaminase  96.28 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1408  deoxycytidine triphosphate deaminase  93.62 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1202  deoxycytidine triphosphate deaminase  91.49 
 
 		 188 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19090  deoxycytidine triphosphate deaminase  92.02 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1646  deoxycytidine triphosphate deaminase  92.02 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19300  deoxycytidine triphosphate deaminase  89.36 
 
 		 188 aa  354  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0990  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.48 
 
 		 188 aa  342  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2620  dCTP deaminase  85.11 
 
 		 188 aa  341  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2114  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 188 aa  338  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1785  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.04 
 
 		 188 aa  337  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000678653  normal  0.0149108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2438  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00886946  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0714  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1215  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5764  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0860  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2346  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522323  normal  0.254872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1822  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2480  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1063  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2433  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2299  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2987  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1612  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00997838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1057  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0861  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0825  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.96 
 
 		 212 aa  333  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3027  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.91 
 
 		 188 aa  332  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2885  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.91 
 
 		 188 aa  332  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1180  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.75 
 
 		 188 aa  332  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2187  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.01 
 
 		 189 aa  332  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.174723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0941  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.45 
 
 		 188 aa  330  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2396  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  330  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.181474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2175  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.85 
 
 		 188 aa  328  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.0718867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3478  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.48 
 
 		 189 aa  328  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2579  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.85 
 
 		 188 aa  328  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425802  normal  0.125537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1019  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.95 
 
 		 189 aa  327  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1965  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.79 
 
 		 189 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0313  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.57 
 
 		 188 aa  325  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0053  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.82 
 
 		 188 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1877  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.57 
 
 		 188 aa  325  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1700  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.68 
 
 		 191 aa  325  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000175213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01242  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.89 
 
 		 189 aa  325  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2366  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.79 
 
 		 188 aa  323  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2755  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.79 
 
 		 188 aa  323  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2286  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.21 
 
 		 188 aa  322  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.777685  hitchhiker  0.000350078 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2660  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.21 
 
 		 188 aa  322  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0577  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 188 aa  321  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1425  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.63 
 
 		 191 aa  321  5e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.703083  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0688  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 188 aa  321  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2107  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.14 
 
 		 188 aa  320  6e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.456906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1588  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.1 
 
 		 191 aa  320  6e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0916  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.14 
 
 		 188 aa  320  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.579624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1060  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.14 
 
 		 188 aa  320  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.571656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2869  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.95 
 
 		 190 aa  320  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3880  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.79 
 
 		 188 aa  319  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0713  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.42 
 
 		 189 aa  319  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2740  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.42 
 
 		 189 aa  318  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1130  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.72 
 
 		 188 aa  318  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.20465  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1050  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.72 
 
 		 188 aa  318  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3293  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.26 
 
 		 189 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1589  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.14 
 
 		 188 aa  316  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.909084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2000  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.96 
 
 		 191 aa  315  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2079  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.96 
 
 		 191 aa  315  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1144  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.66 
 
 		 188 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1505  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.07 
 
 		 188 aa  311  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2148  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.37 
 
 		 201 aa  310  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1049  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.25 
 
 		 199 aa  308  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1337  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.84 
 
 		 203 aa  307  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  decreased coverage  0.000121431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0649  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.72 
 
 		 188 aa  305  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1186  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.87 
 
 		 184 aa  305  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1206  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.19 
 
 		 188 aa  303  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106779  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1314  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.26 
 
 		 184 aa  299  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4050  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.4 
 
 		 184 aa  296  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0146  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.4 
 
 		 184 aa  293  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0762  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.26 
 
 		 184 aa  288  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2446  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.98 
 
 		 186 aa  278  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.45 
 
 		 190 aa  278  4e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2200  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.38 
 
 		 186 aa  277  8e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.55 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1507  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.59 
 
 		 184 aa  275  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2143  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.52 
 
 		 184 aa  274  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.760449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0432  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.12 
 
 		 184 aa  274  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.55 
 
 		 186 aa  273  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0309  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.02 
 
 		 190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.620462  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.78 
 
 		 186 aa  271  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.78 
 
 		 186 aa  271  4.0000000000000004e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4201  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.05 
 
 		 195 aa  271  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_002978  WD0379  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.28 
 
 		 185 aa  271  6e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318983  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.78 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.78 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.31 
 
 		 186 aa  267  7e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1880  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.78 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0964  deoxycytidine triphosphate deaminase  63.98 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0296  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.29 
 
 		 187 aa  251  5.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0707  deoxycytidine triphosphate deaminase  60.22 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>