239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2660 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2660  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2286  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.777685  hitchhiker  0.000350078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0688  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.11 
 
 		 188 aa  342  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2755  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.04 
 
 		 188 aa  340  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1505  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.11 
 
 		 188 aa  338  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2187  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.57 
 
 		 189 aa  338  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.174723 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0714  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 189 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1215  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 189 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1057  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 189 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1063  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 189 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2299  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 189 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2987  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 189 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1612  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 189 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00997838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0860  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.64 
 
 		 189 aa  338  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2148  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.74 
 
 		 201 aa  337  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5764  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.19 
 
 		 189 aa  337  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0861  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.19 
 
 		 189 aa  337  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1822  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.19 
 
 		 189 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2480  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.19 
 
 		 189 aa  337  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2438  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.19 
 
 		 189 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00886946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2433  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.19 
 
 		 189 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2346  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.19 
 
 		 189 aa  337  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522323  normal  0.254872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1144  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.57 
 
 		 188 aa  337  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2175  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.51 
 
 		 188 aa  335  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.0718867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2579  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.98 
 
 		 188 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425802  normal  0.125537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1049  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.74 
 
 		 199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2366  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.98 
 
 		 188 aa  334  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3880  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.49 
 
 		 188 aa  333  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3293  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.54 
 
 		 189 aa  332  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3478  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.54 
 
 		 189 aa  332  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1019  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.98 
 
 		 189 aa  332  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1646  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.85 
 
 		 188 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19090  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.85 
 
 		 188 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1337  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.63 
 
 		 203 aa  330  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  decreased coverage  0.000121431 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0990  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.38 
 
 		 188 aa  330  9e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0053  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.85 
 
 		 188 aa  329  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1408  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.28 
 
 		 188 aa  329  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2740  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.54 
 
 		 189 aa  329  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1130  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.91 
 
 		 188 aa  329  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.20465  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1050  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.91 
 
 		 188 aa  329  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2620  dCTP deaminase  82.35 
 
 		 188 aa  328  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4144  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  81.82 
 
 		 188 aa  327  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1965  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.32 
 
 		 189 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0916  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.28 
 
 		 188 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.579624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1060  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.28 
 
 		 188 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.571656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3883  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.28 
 
 		 188 aa  325  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1180  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.19 
 
 		 188 aa  324  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0577  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.21 
 
 		 188 aa  323  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2107  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 188 aa  323  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.456906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1100  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.21 
 
 		 188 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1140  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.21 
 
 		 188 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0341669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1129  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.75 
 
 		 188 aa  321  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.929704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19300  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.85 
 
 		 188 aa  322  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0713  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.89 
 
 		 189 aa  321  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0941  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.72 
 
 		 188 aa  320  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 188 aa  320  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2396  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.79 
 
 		 189 aa  319  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.181474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2114  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.72 
 
 		 188 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0825  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.19 
 
 		 212 aa  317  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0649  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.89 
 
 		 188 aa  317  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1202  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 188 aa  316  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1589  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.61 
 
 		 188 aa  316  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.909084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1700  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.95 
 
 		 191 aa  316  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000175213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1785  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.72 
 
 		 188 aa  315  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000678653  normal  0.0149108 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1425  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.47 
 
 		 191 aa  313  8e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.703083  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1206  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.84 
 
 		 188 aa  313  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106779  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1588  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.47 
 
 		 191 aa  313  9e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3027  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.54 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2885  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.54 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1877  deoxycytidine triphosphate deaminase  75 
 
 		 188 aa  310  7.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2869  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.66 
 
 		 190 aa  310  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0313  deoxycytidine triphosphate deaminase  75 
 
 		 188 aa  310  7.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01242  deoxycytidine triphosphate deaminase  75 
 
 		 189 aa  309  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2079  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.87 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2000  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.87 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1186  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.26 
 
 		 184 aa  300  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1314  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.26 
 
 		 184 aa  294  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0309  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.28 
 
 		 190 aa  286  2e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.620462  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.98 
 
 		 190 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.45 
 
 		 186 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4050  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.66 
 
 		 184 aa  280  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.91 
 
 		 186 aa  278  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2200  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.91 
 
 		 186 aa  279  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.91 
 
 		 186 aa  278  4e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0146  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.66 
 
 		 184 aa  278  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0762  deoxycytidine triphosphate deaminase  72.73 
 
 		 184 aa  278  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0432  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.26 
 
 		 184 aa  276  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.84 
 
 		 186 aa  276  2e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.84 
 
 		 186 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4201  deoxycytidine triphosphate deaminase  72.73 
 
 		 195 aa  274  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2446  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.98 
 
 		 186 aa  274  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.84 
 
 		 186 aa  274  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.84 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0379  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.74 
 
 		 185 aa  265  4e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2143  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.38 
 
 		 184 aa  264  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.760449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1507  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.38 
 
 		 184 aa  261  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1880  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.24 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0964  deoxycytidine triphosphate deaminase  63.44 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  62.57 
 
 		 182 aa  241  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0296  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.29 
 
 		 187 aa  240  7e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>