240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4144 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4144  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  100 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3883  deoxycytidine triphosphate deaminase  99.47 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1100  deoxycytidine triphosphate deaminase  96.81 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1129  deoxycytidine triphosphate deaminase  96.81 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.929704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1140  deoxycytidine triphosphate deaminase  96.81 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0341669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  96.28 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1408  deoxycytidine triphosphate deaminase  93.62 
 
 		 188 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19090  deoxycytidine triphosphate deaminase  91.49 
 
 		 188 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19300  deoxycytidine triphosphate deaminase  91.49 
 
 		 188 aa  364  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1646  deoxycytidine triphosphate deaminase  91.49 
 
 		 188 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1202  deoxycytidine triphosphate deaminase  90.96 
 
 		 188 aa  359  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0990  deoxycytidine triphosphate deaminase  86.02 
 
 		 188 aa  345  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2620  dCTP deaminase  85.64 
 
 		 188 aa  345  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2114  deoxycytidine triphosphate deaminase  87.23 
 
 		 188 aa  343  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0825  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.56 
 
 		 212 aa  340  7e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2187  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.174723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2579  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.45 
 
 		 188 aa  334  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425802  normal  0.125537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0860  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2438  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00886946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5764  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2346  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522323  normal  0.254872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1822  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2480  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2433  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0861  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2175  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.45 
 
 		 188 aa  334  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.0718867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1057  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  333  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0714  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  333  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972312  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3027  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.98 
 
 		 188 aa  333  9e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2885  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.98 
 
 		 188 aa  333  9e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1215  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  333  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1063  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  333  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2299  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  333  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2987  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  333  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1612  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 		 189 aa  333  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00997838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3478  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.54 
 
 		 189 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0941  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.51 
 
 		 188 aa  332  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1785  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.98 
 
 		 188 aa  332  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000678653  normal  0.0149108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2396  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.6 
 
 		 189 aa  331  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.181474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1019  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.01 
 
 		 189 aa  331  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1180  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.75 
 
 		 188 aa  330  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2366  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.38 
 
 		 188 aa  330  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2755  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.38 
 
 		 188 aa  329  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0313  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.65 
 
 		 188 aa  328  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1877  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.65 
 
 		 188 aa  328  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3880  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.91 
 
 		 188 aa  328  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0688  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.28 
 
 		 188 aa  327  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2660  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.82 
 
 		 188 aa  327  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2286  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.82 
 
 		 188 aa  327  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.777685  hitchhiker  0.000350078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0053  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.28 
 
 		 188 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1965  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.32 
 
 		 189 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1700  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.15 
 
 		 191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000175213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3293  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.38 
 
 		 189 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0577  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.75 
 
 		 188 aa  324  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2740  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.01 
 
 		 189 aa  324  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1425  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.63 
 
 		 191 aa  323  7e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.703083  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1588  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.1 
 
 		 191 aa  323  9e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2107  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 188 aa  322  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.456906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0916  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 188 aa  322  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.579624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1060  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 188 aa  322  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.571656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01242  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.84 
 
 		 189 aa  322  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1050  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.72 
 
 		 188 aa  320  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1130  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.72 
 
 		 188 aa  320  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.20465  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1144  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.79 
 
 		 188 aa  320  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907241 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0713  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.58 
 
 		 189 aa  320  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1505  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.21 
 
 		 188 aa  319  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1589  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.14 
 
 		 188 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.909084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2148  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.47 
 
 		 201 aa  318  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1049  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.37 
 
 		 199 aa  315  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2869  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.37 
 
 		 190 aa  314  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2000  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.44 
 
 		 191 aa  314  5e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2079  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.44 
 
 		 191 aa  313  7e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0649  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.31 
 
 		 188 aa  313  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1206  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.78 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106779  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1337  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.89 
 
 		 203 aa  310  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  decreased coverage  0.000121431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1186  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.87 
 
 		 184 aa  306  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1314  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.33 
 
 		 184 aa  304  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4050  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.33 
 
 		 184 aa  293  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0146  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.33 
 
 		 184 aa  290  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0762  deoxycytidine triphosphate deaminase  72.73 
 
 		 184 aa  287  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2200  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.98 
 
 		 186 aa  283  7e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000430828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.05 
 
 		 186 aa  283  9e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.05 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2446  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.52 
 
 		 186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.52 
 
 		 190 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0432  deoxycytidine triphosphate deaminase  72.19 
 
 		 184 aa  279  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0309  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.62 
 
 		 190 aa  278  3e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.620462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4201  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.12 
 
 		 195 aa  275  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_002978  WD0379  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.35 
 
 		 185 aa  274  5e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318983  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.31 
 
 		 186 aa  273  8e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.31 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2143  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.52 
 
 		 184 aa  272  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.760449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.31 
 
 		 186 aa  272  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1507  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.52 
 
 		 184 aa  272  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.31 
 
 		 186 aa  271  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.38 
 
 		 186 aa  270  8.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1880  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.38 
 
 		 186 aa  263  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0964  deoxycytidine triphosphate deaminase  64.52 
 
 		 185 aa  261  6e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  63.64 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0296  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.29 
 
 		 187 aa  246  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>