294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4348 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  94.09 
 
 		 189 aa  355  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  88.17 
 
 		 190 aa  342  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  88.71 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  88.71 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  88.71 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  87.1 
 
 		 190 aa  339  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.95 
 
 		 190 aa  333  9e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.65 
 
 		 196 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.65 
 
 		 211 aa  309  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.57 
 
 		 196 aa  308  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.68 
 
 		 195 aa  305  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.03 
 
 		 192 aa  304  5.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.03 
 
 		 192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.84 
 
 		 201 aa  301  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.49 
 
 		 193 aa  300  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.34 
 
 		 191 aa  299  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.34 
 
 		 191 aa  298  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.81 
 
 		 191 aa  297  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.34 
 
 		 191 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.34 
 
 		 199 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.73 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.66 
 
 		 196 aa  290  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.21 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  72.58 
 
 		 193 aa  288  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.27 
 
 		 196 aa  288  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.51 
 
 		 191 aa  288  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.66 
 
 		 193 aa  288  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  72.11 
 
 		 191 aa  287  8e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  72.04 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.66 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.9 
 
 		 194 aa  282  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.97 
 
 		 194 aa  278  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  69.84 
 
 		 191 aa  275  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.13 
 
 		 193 aa  261  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.25 
 
 		 194 aa  261  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  65.59 
 
 		 193 aa  260  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  64.52 
 
 		 197 aa  251  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  63.78 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  60.99 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  55 
 
 		 192 aa  200  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  49.74 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  51.6 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.72 
 
 		 195 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.39 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  47.94 
 
 		 196 aa  165  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.39 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.39 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.84 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.84 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.84 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  45.95 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  45.26 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  45.26 
 
 		 193 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.02 
 
 		 180 aa  144  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  43.92 
 
 		 195 aa  144  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.7 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2355  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.430961 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.78 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.417752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  43.09 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  44.21 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.16 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.68 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.58 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1899  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.11 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.16 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.97 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  38.83 
 
 		 178 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.11 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2217  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.05 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.54 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2616  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.05 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1658  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.82 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1733  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.82 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00151185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1763  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.82 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1889  deoxycytidine triphosphate deaminase  40 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.0428491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  40 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000265475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2455  deoxycytidine triphosphate deaminase  40 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000233187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2575  deoxycytidine triphosphate deaminase  40 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.25 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.58 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.33 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.53 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0395  2-deoxycytidine 5-triphosphate deaminase  38.42 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.610625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>