More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0561 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
177 aa  358  2e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  60.56 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  51.96 
 
 
178 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  53.63 
 
 
182 aa  191  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  48.57 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.36 
 
 
201 aa  141  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.43 
 
 
191 aa  141  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.28 
 
 
194 aa  140  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.64 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.49 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.55 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  43.32 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.02 
 
 
216 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.36 
 
 
191 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.43 
 
 
196 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.89 
 
 
191 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.89 
 
 
196 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.77 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.32 
 
 
196 aa  134  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.77 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.77 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.31 
 
 
191 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.68 
 
 
191 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.43 
 
 
200 aa  128  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.89 
 
 
195 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.1 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.54 
 
 
191 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.36 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.04 
 
 
195 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.11 
 
 
183 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.77 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.74 
 
 
190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.22 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.3 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.25 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.68 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.71 
 
 
190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.1 
 
 
193 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.78 
 
 
196 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.77 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.77 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.77 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.25 
 
 
192 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.25 
 
 
193 aa  124  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.88 
 
 
187 aa  124  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.84 
 
 
194 aa  124  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.43 
 
 
193 aa  124  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.21 
 
 
194 aa  124  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.74 
 
 
203 aa  124  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.67 
 
 
186 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.33 
 
 
192 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.95 
 
 
196 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.3 
 
 
194 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.07 
 
 
185 aa  121  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  38.3 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.89 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  39.57 
 
 
193 aa  119  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.38 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.27 
 
 
207 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.7 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2002  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.64 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169741  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.79 
 
 
198 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.84 
 
 
172 aa  107  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2556  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.75 
 
 
224 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0711505  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.55 
 
 
179 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0671  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.99 
 
 
206 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.014238  normal  0.109558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  33.99 
 
 
206 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0737  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
206 aa  100  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1899  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
199 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
194 aa  101  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0612  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.09 
 
 
203 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  32.81 
 
 
195 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1247  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.5 
 
 
206 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0198775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.12 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.12 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.12 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.5 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2156  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.91 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0645  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.16 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.09 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 
193 aa  95.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.53 
 
 
171 aa  95.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.16 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.84 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.1 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0395  2-deoxycytidine 5-triphosphate deaminase  33.16 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.610625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.05 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.23 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2241  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.66 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
194 aa  91.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.53 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2067  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.98 
 
 
172 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000164963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.79 
 
 
176 aa  90.9  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1525  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.42 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>