214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1247 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1247  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0198775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0671  deoxycytidine triphosphate deaminase  96.6 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.014238  normal  0.109558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  97.09 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0737  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.92 
 
 
206 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1411  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.38 
 
 
201 aa  317  7e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.21 
 
 
195 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.71 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.24 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.6 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.88 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.65 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.14 
 
 
191 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.18 
 
 
196 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.5 
 
 
191 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.17 
 
 
200 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  33.01 
 
 
191 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.78 
 
 
189 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.65 
 
 
193 aa  104  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  33 
 
 
191 aa  104  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.35 
 
 
194 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
185 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.25 
 
 
187 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.53 
 
 
211 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.17 
 
 
191 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.17 
 
 
190 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.82 
 
 
190 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.82 
 
 
190 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.82 
 
 
190 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.67 
 
 
191 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.14 
 
 
191 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.16 
 
 
191 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  34.47 
 
 
178 aa  101  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.14 
 
 
191 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.68 
 
 
201 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.23 
 
 
194 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.17 
 
 
190 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.68 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.16 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.5 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.46 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.67 
 
 
191 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.53 
 
 
196 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.67 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.67 
 
 
190 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.18 
 
 
193 aa  98.2  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.81 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  31.03 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.18 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.2 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.7 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.66 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.55 
 
 
194 aa  94  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.92 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  32.49 
 
 
187 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.13 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.18 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  31.37 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.23 
 
 
183 aa  90.5  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.55 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.65 
 
 
192 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.65 
 
 
192 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.98 
 
 
200 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.16 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
198 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.22 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.87 
 
 
172 aa  84.7  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0227  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.47 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2616  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.67 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.88 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6270  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.35 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00431284  normal  0.739513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.88 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.51 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.88 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.03 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2241  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.32 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1658  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.67 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1733  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.67 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00151185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1763  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.67 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.69 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2217  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.67 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1525  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.56 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.18 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0645  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.5 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193078  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.68 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.03 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  31.19 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.19 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.69 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2575  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.68 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  28.57 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.68 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000265475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>