49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3391 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  61.58 
 
 		 177 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  31.21 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0746  deoxycytidine triphosphate deaminase (dcD-2)  29.94 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0671531  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0554  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.16 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.059854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  30.77 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  30.95 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.05 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  30.25 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  30.37 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  28 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  27.41 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0123121 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.98 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3384  dUTP diphosphatase  33.71 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  25.93 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.41 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.11 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  26.8 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.11 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  25.66 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.17 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 		 145 aa  51.2  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  25 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1372  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  27.27 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0239095  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  28.78 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  27.66 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  24.83 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.18 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.09 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.09 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0296  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.36 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1529  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.12 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7646  predicted protein  38.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.305343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1337  dUTP diphosphatase  29.89 
 
 		 160 aa  44.3  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.36 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.26 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1801  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  28.57 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.36 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0707  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.28 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0596  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  25.55 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0589  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  32.5 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.18 
 
 		 147 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1877  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.36 
 
 		 188 aa  42  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.25 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0313  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.36 
 
 		 188 aa  42  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.25 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4050  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.28 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>