37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_358 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  97.04 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  96.45 
 
 		 170 aa  333  9e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  51.48 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0123121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  47.34 
 
 		 170 aa  175  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  42.95 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  44.08 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1801  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  39.24 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1372  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  39.44 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0239095  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  39.16 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  38.46 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  38.46 
 
 		 156 aa  94.4  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1337  dUTP diphosphatase  38.31 
 
 		 160 aa  94  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0596  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  37.11 
 
 		 154 aa  94  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  38.57 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3384  dUTP diphosphatase  37.16 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  34.75 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11124  dUTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14580)  37.07 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  30.95 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.24 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.99 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  26.99 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.65 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.82 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.15 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  27.85 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.42 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.45 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.92 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.4 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.86 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.41 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.36 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.52 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.68 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  27.17 
 
 		 182 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  25.15 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>