42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0752 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  100 
 
 		 171 aa  351  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0123121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  72.78 
 
 		 170 aa  261  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  52.66 
 
 		 170 aa  187  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  51.48 
 
 		 170 aa  184  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  50.89 
 
 		 170 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  49.33 
 
 		 177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  47.65 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  42.86 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  42.18 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1372  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  38.89 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0239095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  42.18 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1337  dUTP diphosphatase  39.07 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  38.89 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1801  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  38.78 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0596  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  36.17 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3384  dUTP diphosphatase  36.73 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  37.32 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11124  dUTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14580)  38.68 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  27.41 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  30.89 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  26.12 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  34.21 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.68 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  28.37 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.91 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.32 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.14 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0776  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.01 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.153757  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0746  deoxycytidine triphosphate deaminase (dcD-2)  36.25 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0671531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.32 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.65 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.7 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.07 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.25 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.28 
 
 		 176 aa  42  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0523695 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.27 
 
 		 196 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.59 
 
 		 200 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1529  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.23 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.67 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07970  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  35 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>