37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0415 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  100 
 
 
170 aa  346  9e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  97.04 
 
 
170 aa  338  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  95.29 
 
 
170 aa  332  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  52.66 
 
 
171 aa  187  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0123121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  48.52 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  42.31 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  44.74 
 
 
163 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1801  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  39.38 
 
 
179 aa  101  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1372  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  39.16 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0239095  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  39.16 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  38.46 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0596  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  37.74 
 
 
154 aa  95.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382829  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1337  dUTP diphosphatase  40.54 
 
 
160 aa  94.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  38.46 
 
 
156 aa  94.4  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  38.57 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3384  dUTP diphosphatase  37.84 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  35.46 
 
 
157 aa  84  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11124  dUTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14580)  37.07 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  26.99 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.24 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.99 
 
 
176 aa  54.3  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.07 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.82 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  28.3 
 
 
159 aa  52  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.15 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.42 
 
 
196 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.33 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.92 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.95 
 
 
203 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.4 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.89 
 
 
145 aa  44.3  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.69 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.41 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.5 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.71 
 
 
194 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  39.74 
 
 
206 aa  40.8  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>