49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1584 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  100 
 
 
156 aa  320  5e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  99.36 
 
 
156 aa  319  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  97.44 
 
 
156 aa  313  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  86.54 
 
 
156 aa  284  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1372  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  58.33 
 
 
160 aa  201  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0239095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  42.18 
 
 
171 aa  97.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0123121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  40.71 
 
 
177 aa  98.2  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  38.46 
 
 
170 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  38.46 
 
 
170 aa  97.1  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  38.46 
 
 
170 aa  97.1  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  40.28 
 
 
170 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  37.5 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1801  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  36.36 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  38.69 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0596  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  34.87 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382829  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11124  dUTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14580)  36.97 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1337  dUTP diphosphatase  33.11 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3384  dUTP diphosphatase  30 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  27.74 
 
 
177 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.71 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  25 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.31 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.01 
 
 
201 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.29 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  25 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.39 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.31 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.92 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.95 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.53 
 
 
182 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.4 
 
 
211 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  21.8 
 
 
190 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.4 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1017  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  26.21 
 
 
386 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.2 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.2 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.2 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.13 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.2 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.2 
 
 
191 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.54 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07970  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  36.11 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.32 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  25 
 
 
194 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  26.83 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.06 
 
 
201 aa  41.2  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.74 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2260  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.19 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.25 
 
 
177 aa  40.4  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>