More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2621 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2621  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 143 aa  278  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.603501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0160  GreA/GreB family elongation factor  43.69 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.385905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7065  GreA/GreB family elongation factor  35.29 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1314  GreA/GreB family elongation factor  39.22 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2969  GreA/GreB family elongation factor  39.22 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000763925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2606  GreA/GreB family elongation factor  37.82 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0149919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4883  GreA/GreB family elongation factor  38.46 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0732  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  33.06 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2844  GreA/GreB family elongation factor  45.78 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2439  GreA/GreB family elongation factor  41.75 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.53046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2193  GreA/GreB family elongation factor  33.88 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0127687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0686  GreA/GreB family elongation factor  39.45 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2799  GreA/GreB family elongation factor  37.61 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28493  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1645  GreA/GreB family elongation factor  30.77 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.169822  normal  0.646556 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  40.66 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5464  GreA/GreB family elongation factor  36.75 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2074  transcription elongation factor GreA/GreB domain protein  31.71 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1764  GreA/GreB family elongation factor  38.05 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0414  GreA/GreB family elongation factor  33.6 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2929  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.7 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3128  GreA/GreB family elongation factor  34.62 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  34.92 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3357  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  38.14 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  36.8 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2872  GreA/GreB family elongation factor  36.72 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1597  GreA/GreB family elongation factor  33.91 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323203  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5468  GreA/GreB family elongation factor  33.59 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.699388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0836  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  31.71 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0929848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2003  GreA/GreB family elongation factor  38.55 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2619  GreA/GreB family elongation factor  41.86 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2466  GreA/GreB family elongation factor  34.62 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  38.46 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.14 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1519  GreA/GreB family elongation factor  31.4 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2147  GreA/GreB family elongation factor  32.8 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3626  transcription elongation factor  30.77 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  40.74 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3604  GreA/GreB family elongation factor  31.53 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0942  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.86 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  34.96 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1248  GreA/GreB family elongation factor  29.6 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0614  nucleoside diphosphate kinase regulator  34.91 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1918  transcription elongation factor  33.08 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  29.92 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  35.23 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4724  nucleoside diphosphate kinase regulator  34.85 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186623  normal  0.0958356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  36.56 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  31.25 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0539  GreA/GreB family elongation factor  32.17 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  36.56 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2294  GreA/GreB family elongation factor  35.05 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  36.96 
 
 		 235 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  35.48 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5467  GreA/GreB family elongation factor  32.79 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.521528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2805  GreA/GreB family elongation factor  35.16 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75777  normal  0.289356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  40.22 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2265  GreA/GreB family elongation factor  33.6 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.4 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.4 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  35.29 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2202  nucleoside diphosphate kinase regulator  35 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  39.18 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  35.48 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  36.14 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  39.18 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  39.18 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  37.04 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2490  GreA/GreB family elongation factor  34.62 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0163  transcription elongation factor GreA  33.67 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0827  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2402  GreA/GreB family elongation factor  33.04 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3421  GreA/GreB family elongation factor  36.21 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0543  GreA/GreB family elongation factor  31.3 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  32.99 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  38.2 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  37.11 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.32 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  37.11 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  37.11 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  43.08 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00578  nucleoside diphosphate kinase regulator  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2511  GreA/GreB family elongation factor  32.8 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00542547  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5337  GreA/GreB family elongation factor  31.4 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.641295 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3015  GreA/GreB family elongation factor  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00240658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0524  nucleoside diphosphate kinase regulator  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3034  nucleoside diphosphate kinase regulator  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0661  nucleoside diphosphate kinase regulator  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00567  hypothetical protein  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0697  nucleoside diphosphate kinase regulator  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  37.11 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1840  GreA/GreB family elongation factor  32.8 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000293158  normal  0.0180597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2624  GreA/GreB family elongation factor  32.8 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0629  nucleoside diphosphate kinase regulator  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2504  GreA/GreB family elongation factor  32.8 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000671483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0632  nucleoside diphosphate kinase regulator  29.81 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4551  GreA/GreB family elongation factor  33.63 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404649  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  31.82 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  34.78 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>