More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3421 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3421  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0922  transcription elongation factor GreA/GreB region  81.08 
 
 		 151 aa  228  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  66.41 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0934  GreA/GreB family elongation factor  57.69 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4551  GreA/GreB family elongation factor  56.15 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404649  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5468  GreA/GreB family elongation factor  51.22 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.699388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  47.93 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3357  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  47.86 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4724  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.31 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186623  normal  0.0958356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2929  nucleoside diphosphate kinase regulator  49.59 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5464  GreA/GreB family elongation factor  46.28 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2490  GreA/GreB family elongation factor  46.15 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2799  GreA/GreB family elongation factor  48.39 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0942  nucleoside diphosphate kinase regulator  47.93 
 
 		 136 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286674  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0414  GreA/GreB family elongation factor  43.94 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  42.28 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.6 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1918  transcription elongation factor  44.83 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0686  GreA/GreB family elongation factor  44.26 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3467  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.27 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0614  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.64 
 
 		 169 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5337  GreA/GreB family elongation factor  46.34 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.641295 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5467  GreA/GreB family elongation factor  42.64 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.521528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5068  GreA/GreB family elongation factor  41.98 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  39.69 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4145  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.74 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4275  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.9 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  45.13 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4254  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.74 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  43.33 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0271  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.15 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  38.71 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  40.98 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0543  GreA/GreB family elongation factor  43.33 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.32 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2624  GreA/GreB family elongation factor  44.74 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2504  GreA/GreB family elongation factor  44.74 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000671483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2872  GreA/GreB family elongation factor  38.46 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2511  GreA/GreB family elongation factor  44.74 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00542547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0539  GreA/GreB family elongation factor  43.33 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.32 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1840  GreA/GreB family elongation factor  44.74 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000293158  normal  0.0180597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0827  GreA/GreB family elongation factor  45.36 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2202  nucleoside diphosphate kinase regulator  39.84 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04592  regulator of nucleoside diphosphate kinase  39.29 
 
 		 215 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2466  GreA/GreB family elongation factor  39.32 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2147  GreA/GreB family elongation factor  40.17 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.01 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1764  GreA/GreB family elongation factor  43.36 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1935  regulator of nucleoside diphosphate kinase  44.74 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0578  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.34 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1639  GreA/GreB family elongation factor  44.92 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1714  GreA/GreB family elongation factor  44.92 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00341576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1714  GreA/GreB family elongation factor  44.74 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000114575  normal  0.140273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2265  GreA/GreB family elongation factor  45.22 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0229  regulator of nucleoside diphosphate kinase  36.8 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0066  GreA/GreB family elongation factor  37.72 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0787591  normal  0.343194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2003  GreA/GreB family elongation factor  40.68 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0898  GreA/GreB family elongation factor  33.88 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0178  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.8 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2402  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.54 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3058  GreA/GreB family elongation factor  35.77 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.26553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2294  GreA/GreB family elongation factor  36.28 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2805  GreA/GreB family elongation factor  36.28 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75777  normal  0.289356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0249  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.7 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1433  GreA/GreB family elongation factor  38.26 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0955  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  29.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0336  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  29.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1352  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  29.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.833636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2477  regulator of nucleoside diphosphate kinase  29.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1288  regulator of nucleoside diphosphate kinase  29.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.783972  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0614  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  29.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3604  GreA/GreB family elongation factor  37.3 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5223  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.89 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4589  GreA/GreB family elongation factor  32.48 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020326  hitchhiker  0.00331531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5132  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.89 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1616  GreA/GreB family elongation factor  37.7 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4125  GreA/GreB family elongation factor  32.48 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.210831  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3941  GreA/GreB family elongation factor  34.21 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.889292  normal  0.878716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5284  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.07 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0160  GreA/GreB family elongation factor  37.7 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.385905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3244  GreA/GreB family elongation factor  36.75 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3633  GreA/GreB family elongation factor  30.77 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5548  GreA/GreB family elongation factor  30.77 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4734  GreA/GreB family elongation factor  30.77 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194028  normal  0.017468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1024  GreA/GreB family elongation factor  30.77 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0448635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1517  nucleoside diphosphate kinase regulator, putative  29.91 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1215  regulator of nucleoside diphosphate kinase  28.21 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1894  GreA/GreB family elongation factor  36.59 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1248  GreA/GreB family elongation factor  37.29 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1519  GreA/GreB family elongation factor  35.71 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2044  regulator of nucleoside diphosphate kinase  33.63 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0276  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.04 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0269  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.88 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1165  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.88 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.29507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0493  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.88 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1597  GreA/GreB family elongation factor  37.93 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0429  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.88 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>