More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0922 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0922  transcription elongation factor GreA/GreB region  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3421  GreA/GreB family elongation factor  81.08 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  60.99 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0934  GreA/GreB family elongation factor  53.33 
 
 		 134 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4551  GreA/GreB family elongation factor  54.96 
 
 		 134 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404649  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5468  GreA/GreB family elongation factor  47.37 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.699388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2799  GreA/GreB family elongation factor  46.27 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  45.04 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5464  GreA/GreB family elongation factor  44.27 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3357  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  44.88 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0942  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.27 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286674  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0414  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2929  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.38 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3467  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.97 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.38 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4724  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.69 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186623  normal  0.0958356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2490  GreA/GreB family elongation factor  41.91 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0686  GreA/GreB family elongation factor  40.88 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1918  transcription elongation factor  41.27 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0614  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.73 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  38.93 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  39.16 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  42.28 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5337  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.641295 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4145  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.38 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5467  GreA/GreB family elongation factor  39.85 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.521528 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4254  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.38 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4275  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.75 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5068  GreA/GreB family elongation factor  42.14 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  41.54 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0271  nucleoside diphosphate kinase regulator  40.44 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  36.69 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  40.15 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0543  GreA/GreB family elongation factor  41.54 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2872  GreA/GreB family elongation factor  37.01 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0539  GreA/GreB family elongation factor  43.08 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1840  GreA/GreB family elongation factor  39.01 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000293158  normal  0.0180597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2511  GreA/GreB family elongation factor  39.01 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00542547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2624  GreA/GreB family elongation factor  39.01 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2504  GreA/GreB family elongation factor  39.01 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000671483  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0827  GreA/GreB family elongation factor  41.12 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2466  GreA/GreB family elongation factor  37.8 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.24 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.24 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.25 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2202  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.4 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04592  regulator of nucleoside diphosphate kinase  35.25 
 
 		 215 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0160  GreA/GreB family elongation factor  36.99 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.385905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1935  regulator of nucleoside diphosphate kinase  38.3 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0898  GreA/GreB family elongation factor  32.82 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275976  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0578  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.03 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0066  GreA/GreB family elongation factor  33.86 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0787591  normal  0.343194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2003  GreA/GreB family elongation factor  36.43 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0249  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.77 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1764  GreA/GreB family elongation factor  41.13 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1639  GreA/GreB family elongation factor  38.19 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1714  GreA/GreB family elongation factor  38.19 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00341576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1714  GreA/GreB family elongation factor  39.01 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000114575  normal  0.140273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0229  regulator of nucleoside diphosphate kinase  34.29 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5223  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.04 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5132  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.04 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2265  GreA/GreB family elongation factor  37.67 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3058  GreA/GreB family elongation factor  34.59 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.26553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2147  GreA/GreB family elongation factor  36.07 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2044  regulator of nucleoside diphosphate kinase  33.33 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0178  nucleoside diphosphate kinase regulator  34.29 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1352  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  29.69 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.833636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2294  GreA/GreB family elongation factor  33.88 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2477  regulator of nucleoside diphosphate kinase  29.69 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0614  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  29.69 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0336  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  29.69 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0955  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  29.69 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1288  regulator of nucleoside diphosphate kinase  29.69 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.783972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2805  GreA/GreB family elongation factor  33.88 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75777  normal  0.289356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5284  nucleoside diphosphate kinase regulator  34.31 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3941  GreA/GreB family elongation factor  33.06 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.889292  normal  0.878716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1433  GreA/GreB family elongation factor  33.81 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4589  GreA/GreB family elongation factor  31.5 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020326  hitchhiker  0.00331531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4125  GreA/GreB family elongation factor  31.5 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.210831  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1616  GreA/GreB family elongation factor  35.51 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1024  GreA/GreB family elongation factor  31.5 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0448635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2402  GreA/GreB family elongation factor  35.77 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5548  GreA/GreB family elongation factor  31.5 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3633  GreA/GreB family elongation factor  31.5 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4734  GreA/GreB family elongation factor  31.5 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194028  normal  0.017468 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1248  GreA/GreB family elongation factor  35.94 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.09 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1215  regulator of nucleoside diphosphate kinase  28.91 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  31.16 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3244  GreA/GreB family elongation factor  34.51 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4026  GreA/GreB family elongation factor  37.36 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2969  GreA/GreB family elongation factor  34.87 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000763925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3604  GreA/GreB family elongation factor  36.03 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2669  GreA/GreB family elongation factor  32.17 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2844  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1517  nucleoside diphosphate kinase regulator, putative  29.27 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1894  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0715  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.62 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0656  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.62 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1450  GreA/GreB family elongation factor  42.65 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.203216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>