192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04592 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04592  regulator of nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0686  GreA/GreB family elongation factor  57.81 
 
 		 134 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0898  GreA/GreB family elongation factor  39.85 
 
 		 135 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.03 
 
 		 134 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0271  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.52 
 
 		 135 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.03 
 
 		 134 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.54 
 
 		 136 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4382  nucleoside diphosphate kinase regulator  39.1 
 
 		 136 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0249  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.42 
 
 		 136 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0229  regulator of nucleoside diphosphate kinase  43.51 
 
 		 135 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5223  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.98 
 
 		 136 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5132  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.98 
 
 		 136 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5284  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.67 
 
 		 136 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1165  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.59 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.29507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0493  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.59 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0429  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.59 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1639  GreA/GreB family elongation factor  40.6 
 
 		 135 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1714  GreA/GreB family elongation factor  40.6 
 
 		 135 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00341576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3820  nucleoside diphosphate kinase regulator  39.1 
 
 		 136 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0178  nucleoside diphosphate kinase regulator  40.46 
 
 		 135 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0732  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  39.26 
 
 		 142 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1918  transcription elongation factor  48.45 
 
 		 129 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  39.1 
 
 		 137 aa  89.4  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.35 
 
 		 136 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  39.85 
 
 		 136 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2265  GreA/GreB family elongation factor  39.1 
 
 		 135 aa  88.2  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1597  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 137 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2624  GreA/GreB family elongation factor  38.35 
 
 		 135 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1840  GreA/GreB family elongation factor  38.35 
 
 		 135 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000293158  normal  0.0180597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1714  GreA/GreB family elongation factor  39.85 
 
 		 135 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000114575  normal  0.140273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2511  GreA/GreB family elongation factor  38.35 
 
 		 135 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00542547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2504  GreA/GreB family elongation factor  38.35 
 
 		 135 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000671483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0269  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.09 
 
 		 136 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  43.7 
 
 		 137 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0276  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.09 
 
 		 136 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0715  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.09 
 
 		 136 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0775  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.09 
 
 		 136 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0656  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.09 
 
 		 136 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0729  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.09 
 
 		 136 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.309798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0543  GreA/GreB family elongation factor  43.7 
 
 		 138 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3662  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.84 
 
 		 136 aa  85.1  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.587976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2147  GreA/GreB family elongation factor  36.09 
 
 		 137 aa  85.5  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0670  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.09 
 
 		 136 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3421  GreA/GreB family elongation factor  39.29 
 
 		 141 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  41.35 
 
 		 137 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00578  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.15 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3015  GreA/GreB family elongation factor  36.15 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00240658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3034  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.15 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0661  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.15 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0629  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.15 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0697  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.15 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0524  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.15 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1616  GreA/GreB family elongation factor  35.11 
 
 		 137 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00567  hypothetical protein  36.15 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1935  regulator of nucleoside diphosphate kinase  38.35 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  36.92 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1764  GreA/GreB family elongation factor  38.35 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0539  GreA/GreB family elongation factor  43.7 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2402  GreA/GreB family elongation factor  41.79 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0160  GreA/GreB family elongation factor  35.71 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.385905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4026  GreA/GreB family elongation factor  40.54 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1519  GreA/GreB family elongation factor  35.88 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  47.01 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1314  GreA/GreB family elongation factor  37.4 
 
 		 143 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3298  transcription elongation factor GreA/GreB region  36.69 
 
 		 139 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0632  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.38 
 
 		 136 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2606  GreA/GreB family elongation factor  38.46 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0149919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5464  GreA/GreB family elongation factor  37.5 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2439  GreA/GreB family elongation factor  37.88 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.53046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0066  GreA/GreB family elongation factor  37.59 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0787591  normal  0.343194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1248  GreA/GreB family elongation factor  35.88 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2003  GreA/GreB family elongation factor  32.33 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3244  GreA/GreB family elongation factor  37.5 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0942  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.15 
 
 		 136 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286674  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5337  GreA/GreB family elongation factor  42.86 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.641295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0922  transcription elongation factor GreA/GreB region  35.25 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4883  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2969  GreA/GreB family elongation factor  35.88 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000763925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  36.59 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2805  GreA/GreB family elongation factor  38.35 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75777  normal  0.289356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3455  GreA/GreB family elongation factor  40.74 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3357  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  37.5 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2294  GreA/GreB family elongation factor  38.35 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1433  GreA/GreB family elongation factor  36.09 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000067  regulator of nucleoside diphosphate kinase  37.5 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0657287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2844  GreA/GreB family elongation factor  35.88 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0836  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  32.8 
 
 		 135 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0929848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1517  nucleoside diphosphate kinase regulator, putative  39.58 
 
 		 132 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3626  transcription elongation factor  28.46 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  35.71 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  32.35 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2044  regulator of nucleoside diphosphate kinase  39.42 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5468  GreA/GreB family elongation factor  39.52 
 
 		 140 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.699388 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1352  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  37.5 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.833636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4551  GreA/GreB family elongation factor  37.9 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404649  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2872  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 135 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1288  regulator of nucleoside diphosphate kinase  37.5 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.783972  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1215  regulator of nucleoside diphosphate kinase  37.5 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0955  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  37.5 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.87 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>