More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0836 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0836  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0929848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0732  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  53.28 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2606  GreA/GreB family elongation factor  49.62 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0149919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2969  GreA/GreB family elongation factor  46.62 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000763925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1314  GreA/GreB family elongation factor  46.62 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0160  GreA/GreB family elongation factor  49.62 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.385905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2439  GreA/GreB family elongation factor  44.36 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.53046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1519  GreA/GreB family elongation factor  45.86 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3128  GreA/GreB family elongation factor  45.8 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2147  GreA/GreB family elongation factor  40.88 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2844  GreA/GreB family elongation factor  44.27 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1764  GreA/GreB family elongation factor  39.69 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.53 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4883  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  43.85 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.8 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1597  GreA/GreB family elongation factor  42.64 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  40.91 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2003  GreA/GreB family elongation factor  38.69 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2265  GreA/GreB family elongation factor  41.91 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  37.96 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2511  GreA/GreB family elongation factor  41.91 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00542547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2504  GreA/GreB family elongation factor  41.91 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000671483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1840  GreA/GreB family elongation factor  41.91 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000293158  normal  0.0180597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2624  GreA/GreB family elongation factor  41.91 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0898  GreA/GreB family elongation factor  40.31 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1616  GreA/GreB family elongation factor  39.39 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1639  GreA/GreB family elongation factor  41.18 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1714  GreA/GreB family elongation factor  41.18 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00341576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3662  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.24 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.587976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  36.76 
 
 		 136 aa  93.6  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3820  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.24 
 
 		 136 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2805  GreA/GreB family elongation factor  38.64 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75777  normal  0.289356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0283  GreA/GreB family elongation factor  41.41 
 
 		 303 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1935  regulator of nucleoside diphosphate kinase  40.44 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2294  GreA/GreB family elongation factor  38.64 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1433  GreA/GreB family elongation factor  38.93 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1714  GreA/GreB family elongation factor  40.44 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000114575  normal  0.140273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2402  GreA/GreB family elongation factor  38.17 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1450  GreA/GreB family elongation factor  37.98 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2669  GreA/GreB family elongation factor  38.46 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3626  transcription elongation factor  36.59 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2872  GreA/GreB family elongation factor  41.04 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5223  nucleoside diphosphate kinase regulator  40.44 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5132  nucleoside diphosphate kinase regulator  40.44 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1215  regulator of nucleoside diphosphate kinase  35.29 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2466  GreA/GreB family elongation factor  43.18 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5284  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.04 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0276  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.11 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0269  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.36 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.29 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4382  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.5 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0249  nucleoside diphosphate kinase regulator  40.3 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0271  nucleoside diphosphate kinase regulator  39.39 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1288  regulator of nucleoside diphosphate kinase  34.56 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.783972  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1352  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  34.56 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.833636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2477  regulator of nucleoside diphosphate kinase  34.56 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0955  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  34.56 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0336  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  34.56 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0614  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  34.56 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  36.29 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3455  GreA/GreB family elongation factor  40.16 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000067  regulator of nucleoside diphosphate kinase  34.07 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1517  nucleoside diphosphate kinase regulator, putative  34.56 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1645  GreA/GreB family elongation factor  32.5 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.169822  normal  0.646556 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0066  GreA/GreB family elongation factor  37.88 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0787591  normal  0.343194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0229  regulator of nucleoside diphosphate kinase  39.69 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1248  GreA/GreB family elongation factor  36.92 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0493  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.09 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1165  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.09 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.29507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0429  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.09 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2636  putative regulator of nucleoside diphosphate kinase transcription regulator protein  37.78 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3298  transcription elongation factor GreA/GreB region  36.92 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.96 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0715  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.35 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  38.32 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0775  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.35 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0729  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.35 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.309798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0656  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.35 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0686  GreA/GreB family elongation factor  32.76 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0670  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.35 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1024  GreA/GreB family elongation factor  34.56 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0448635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0827  GreA/GreB family elongation factor  40.2 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3633  GreA/GreB family elongation factor  34.56 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5548  GreA/GreB family elongation factor  34.56 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4734  GreA/GreB family elongation factor  34.56 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194028  normal  0.017468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0178  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.17 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4125  GreA/GreB family elongation factor  33.82 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.210831  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4589  GreA/GreB family elongation factor  33.82 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020326  hitchhiker  0.00331531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04592  regulator of nucleoside diphosphate kinase  32.8 
 
 		 215 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2074  transcription elongation factor GreA/GreB domain protein  30.08 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1918  transcription elongation factor  36.84 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6013  GreA/GreB family elongation factor  35.16 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.886926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0539  GreA/GreB family elongation factor  37.86 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3941  GreA/GreB family elongation factor  33.82 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.889292  normal  0.878716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  36.44 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  37.04 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.32 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0661  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.85 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3034  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.85 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>