203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0510 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 
137 aa  267  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0543  GreA/GreB family elongation factor  97.62 
 
 
138 aa  244  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0539  GreA/GreB family elongation factor  96.83 
 
 
138 aa  241  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  57.81 
 
 
138 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2929  nucleoside diphosphate kinase regulator  54.47 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0942  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.72 
 
 
136 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286674  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.45 
 
 
142 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1918  transcription elongation factor  47.5 
 
 
129 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0269  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.7 
 
 
136 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0276  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.7 
 
 
136 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3244  GreA/GreB family elongation factor  46.15 
 
 
164 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4382  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0732  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  46.51 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0614  nucleoside diphosphate kinase regulator  47.93 
 
 
169 aa  98.6  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3662  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.587976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2969  GreA/GreB family elongation factor  42.75 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000763925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0686  GreA/GreB family elongation factor  46.28 
 
 
134 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2606  GreA/GreB family elongation factor  43.41 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0149919  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0775  nucleoside diphosphate kinase regulator  46.21 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0656  nucleoside diphosphate kinase regulator  46.21 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0670  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0729  nucleoside diphosphate kinase regulator  46.21 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.309798  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0715  nucleoside diphosphate kinase regulator  46.21 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3820  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.45 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0632  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0160  GreA/GreB family elongation factor  42.31 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.385905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1519  GreA/GreB family elongation factor  40.77 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4551  GreA/GreB family elongation factor  43.65 
 
 
134 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404649  normal  0.630321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00578  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3015  GreA/GreB family elongation factor  45.86 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00240658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0661  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00567  hypothetical protein  45.86 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0524  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0629  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3034  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0697  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.86 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  44.44 
 
 
136 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0898  GreA/GreB family elongation factor  48.03 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1314  GreA/GreB family elongation factor  41.22 
 
 
143 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  43.08 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0934  GreA/GreB family elongation factor  44.44 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1165  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.94 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.29507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0493  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.94 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3128  GreA/GreB family elongation factor  38.06 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2844  GreA/GreB family elongation factor  41.98 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5468  GreA/GreB family elongation factor  44.88 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.699388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0429  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.94 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5464  GreA/GreB family elongation factor  42.06 
 
 
137 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0271  nucleoside diphosphate kinase regulator  46.88 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.52 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.45 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3357  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  45 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4883  GreA/GreB family elongation factor  40.44 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  45.74 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2202  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.64 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  41.04 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3298  transcription elongation factor GreA/GreB region  44.27 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2799  GreA/GreB family elongation factor  44.8 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2624  GreA/GreB family elongation factor  42.4 
 
 
135 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2504  GreA/GreB family elongation factor  42.4 
 
 
135 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000671483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1840  GreA/GreB family elongation factor  42.4 
 
 
135 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000293158  normal  0.0180597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2511  GreA/GreB family elongation factor  42.4 
 
 
135 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00542547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1935  regulator of nucleoside diphosphate kinase  44.19 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  41.94 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3421  GreA/GreB family elongation factor  43.33 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04592  regulator of nucleoside diphosphate kinase  44.44 
 
 
215 aa  88.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0249  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.86 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.580853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3455  GreA/GreB family elongation factor  43.31 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1639  GreA/GreB family elongation factor  43.41 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011881  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1714  GreA/GreB family elongation factor  43.41 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00341576  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2439  GreA/GreB family elongation factor  39.71 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.53046  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1352  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  42.42 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.833636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2477  regulator of nucleoside diphosphate kinase  42.42 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0336  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  42.42 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0614  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  42.42 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1288  regulator of nucleoside diphosphate kinase  42.42 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.783972  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0955  putative nucleoside diphosphate kinase regulator  42.42 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3467  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.62 
 
 
135 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5223  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.86 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.11 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5132  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.86 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5284  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.86 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.11 
 
 
134 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  39.02 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1714  GreA/GreB family elongation factor  43.41 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000114575  normal  0.140273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1450  GreA/GreB family elongation factor  42.64 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2872  GreA/GreB family elongation factor  41.73 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2265  GreA/GreB family elongation factor  41.6 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2466  GreA/GreB family elongation factor  43.31 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1215  regulator of nucleoside diphosphate kinase  41.67 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0229  regulator of nucleoside diphosphate kinase  42.64 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  40.48 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1894  GreA/GreB family elongation factor  42.98 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0922  transcription elongation factor GreA/GreB region  41.54 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0578  nucleoside diphosphate kinase regulator  48.94 
 
 
146 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2669  GreA/GreB family elongation factor  41.86 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0178  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.64 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2003  GreA/GreB family elongation factor  37.1 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000067  regulator of nucleoside diphosphate kinase  37.59 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0657287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2044  regulator of nucleoside diphosphate kinase  42.4 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>