290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0686 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0686  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 
134 aa  270  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04592  regulator of nucleoside diphosphate kinase  57.81 
 
 
215 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  52.03 
 
 
136 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0271  nucleoside diphosphate kinase regulator  51.54 
 
 
135 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0249  nucleoside diphosphate kinase regulator  49.18 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.580853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5223  nucleoside diphosphate kinase regulator  48.36 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0229  regulator of nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 
135 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5284  nucleoside diphosphate kinase regulator  48.36 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5132  nucleoside diphosphate kinase regulator  48.36 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  48.78 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  48.78 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0178  nucleoside diphosphate kinase regulator  50 
 
 
135 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3820  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.92 
 
 
136 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4382  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.07 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0898  GreA/GreB family elongation factor  42.28 
 
 
135 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0429  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.07 
 
 
136 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1918  transcription elongation factor  48.74 
 
 
129 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0493  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.07 
 
 
136 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1165  nucleoside diphosphate kinase regulator  44.07 
 
 
136 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.29507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1764  GreA/GreB family elongation factor  45.45 
 
 
137 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  42.98 
 
 
137 aa  103  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  45.9 
 
 
136 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3662  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
136 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.587976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0269  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
136 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0276  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
136 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.37 
 
 
136 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3421  GreA/GreB family elongation factor  44.26 
 
 
141 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  44.63 
 
 
137 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00578  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3015  GreA/GreB family elongation factor  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00240658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0524  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0629  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00567  hypothetical protein  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3034  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0697  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0632  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0543  GreA/GreB family elongation factor  47.11 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0661  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.37 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1616  GreA/GreB family elongation factor  45.45 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172196  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0715  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
136 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0539  GreA/GreB family elongation factor  46.72 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0670  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0656  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
136 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0729  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
136 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.309798  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0775  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
136 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  46.28 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2844  GreA/GreB family elongation factor  44.25 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2147  GreA/GreB family elongation factor  39.67 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2003  GreA/GreB family elongation factor  40.16 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2969  GreA/GreB family elongation factor  43.9 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000763925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1894  GreA/GreB family elongation factor  45.45 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1597  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0732  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  40.65 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2265  GreA/GreB family elongation factor  40.31 
 
 
135 aa  96.7  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  39.53 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2504  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000671483  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2511  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00542547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2624  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1314  GreA/GreB family elongation factor  42.28 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1840  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000293158  normal  0.0180597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0922  transcription elongation factor GreA/GreB region  40.88 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1639  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
135 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011881  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1714  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
135 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00341576  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0934  GreA/GreB family elongation factor  43.44 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1714  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000114575  normal  0.140273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0160  GreA/GreB family elongation factor  38.4 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.385905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2439  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.53046  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1935  regulator of nucleoside diphosphate kinase  39.67 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5468  GreA/GreB family elongation factor  44.35 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.699388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2606  GreA/GreB family elongation factor  39.84 
 
 
142 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0149919  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  46.15 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  40.16 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0066  GreA/GreB family elongation factor  39.83 
 
 
138 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0787591  normal  0.343194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1248  GreA/GreB family elongation factor  44.17 
 
 
137 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.9 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0614  nucleoside diphosphate kinase regulator  38.76 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5337  GreA/GreB family elongation factor  44.68 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.641295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1433  GreA/GreB family elongation factor  40.5 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000263626  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0942  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.4 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286674  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4551  GreA/GreB family elongation factor  41.13 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404649  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2799  GreA/GreB family elongation factor  40.54 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28493  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5464  GreA/GreB family elongation factor  37.98 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3467  nucleoside diphosphate kinase regulator  42.62 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2202  nucleoside diphosphate kinase regulator  41.53 
 
 
135 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  34.96 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2402  GreA/GreB family elongation factor  41.46 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5467  GreA/GreB family elongation factor  39.82 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.521528 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000067  regulator of nucleoside diphosphate kinase  42.11 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3298  transcription elongation factor GreA/GreB region  36.36 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4026  GreA/GreB family elongation factor  41.58 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  37.9 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2490  GreA/GreB family elongation factor  42.55 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3357  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  37.93 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0549  nucleoside diphosphate kinase regulator  45.45 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3604  GreA/GreB family elongation factor  34.15 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883906  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3244  GreA/GreB family elongation factor  41.88 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2805  GreA/GreB family elongation factor  38.52 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75777  normal  0.289356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4883  GreA/GreB family elongation factor  36.29 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2294  GreA/GreB family elongation factor  38.84 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5068  GreA/GreB family elongation factor  38.52 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>