More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1645 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1645  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.169822  normal  0.646556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7065  GreA/GreB family elongation factor  60.5 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2193  GreA/GreB family elongation factor  37.39 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0127687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2074  transcription elongation factor GreA/GreB domain protein  37.93 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0732  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  40.78 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2147  GreA/GreB family elongation factor  34.4 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4883  GreA/GreB family elongation factor  33.62 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2606  GreA/GreB family elongation factor  39.13 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0149919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1743  GreA/GreB family elongation factor  32.8 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.100273 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5468  GreA/GreB family elongation factor  39.47 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.699388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4551  GreA/GreB family elongation factor  38.05 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404649  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1764  GreA/GreB family elongation factor  30.71 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0836  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  32.5 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0929848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4181  GreA/GreB family elongation factor  37.72 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2439  GreA/GreB family elongation factor  33.96 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.53046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5223  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.8 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0938  GreA/GreB family elongation factor  30.3 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5284  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.8 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  35.2 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5132  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.8 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0249  nucleoside diphosphate kinase regulator  36.8 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2265  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0518  GreA/GreB family elongation factor  32.48 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69630  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.8 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6016  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.8 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1935  regulator of nucleoside diphosphate kinase  33.07 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2511  GreA/GreB family elongation factor  32.28 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00542547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2624  GreA/GreB family elongation factor  32.28 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1840  GreA/GreB family elongation factor  32.28 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000293158  normal  0.0180597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2504  GreA/GreB family elongation factor  32.28 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000671483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1519  GreA/GreB family elongation factor  38.54 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0229  regulator of nucleoside diphosphate kinase  36.15 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2003  GreA/GreB family elongation factor  32.77 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.108948  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5464  GreA/GreB family elongation factor  34.17 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1639  GreA/GreB family elongation factor  31.5 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1714  GreA/GreB family elongation factor  31.5 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00341576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1433  GreA/GreB family elongation factor  29.92 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0934  GreA/GreB family elongation factor  36.28 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0271  nucleoside diphosphate kinase regulator  34.85 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1314  GreA/GreB family elongation factor  33.03 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3626  transcription elongation factor  33.6 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2969  GreA/GreB family elongation factor  34.31 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000763925 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5467  GreA/GreB family elongation factor  30.47 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.521528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3357  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  35.09 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0898  GreA/GreB family elongation factor  33.06 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0686  GreA/GreB family elongation factor  30.93 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2621  GreA/GreB family elongation factor  30.77 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.603501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4724  nucleoside diphosphate kinase regulator  37.5 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186623  normal  0.0958356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0160  GreA/GreB family elongation factor  34.74 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.385905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0178  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.61 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3128  GreA/GreB family elongation factor  30.83 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1714  GreA/GreB family elongation factor  29.92 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000114575  normal  0.140273 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5337  GreA/GreB family elongation factor  43.42 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.641295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0414  GreA/GreB family elongation factor  31.73 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3604  GreA/GreB family elongation factor  28.93 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5494  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.73 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0510  GreA/GreB family elongation factor  30.91 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3820  nucleoside diphosphate kinase regulator  33.04 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1679  GreA/GreB family elongation factor  29.84 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.700958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0543  GreA/GreB family elongation factor  30.91 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0557  GreA/GreB family elongation factor  30.09 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1616  GreA/GreB family elongation factor  36.08 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2929  nucleoside diphosphate kinase regulator  34.43 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0276  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.76 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0827  GreA/GreB family elongation factor  40.79 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0539  GreA/GreB family elongation factor  30 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2799  GreA/GreB family elongation factor  34.78 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2844  GreA/GreB family elongation factor  35.23 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3680  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.58 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0614  nucleoside diphosphate kinase regulator  35.58 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4382  nucleoside diphosphate kinase regulator  30.1 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1684  GreA/GreB family elongation factor  31.67 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0269  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.3 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1148  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.26 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000067  regulator of nucleoside diphosphate kinase  29.92 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3467  nucleoside diphosphate kinase regulator  34.96 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2202  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.81 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2669  GreA/GreB family elongation factor  32.61 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3662  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.99 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.587976  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1918  transcription elongation factor  30.39 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0493  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.96 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1450  GreA/GreB family elongation factor  33.75 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1165  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.96 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.29507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0429  nucleoside diphosphate kinase regulator  31.96 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1597  GreA/GreB family elongation factor  29.41 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0942  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.38 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286674  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0066  GreA/GreB family elongation factor  28.15 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0787591  normal  0.343194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3421  GreA/GreB family elongation factor  28.45 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0578  nucleoside diphosphate kinase regulator  43.42 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0729  nucleoside diphosphate kinase regulator  30.93 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.309798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0922  transcription elongation factor GreA/GreB region  27.07 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0775  nucleoside diphosphate kinase regulator  30.93 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1215  regulator of nucleoside diphosphate kinase  34.78 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0715  nucleoside diphosphate kinase regulator  30.93 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3455  GreA/GreB family elongation factor  32.63 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0656  nucleoside diphosphate kinase regulator  30.93 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0549  nucleoside diphosphate kinase regulator  32.61 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  32.63 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>