140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2500 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2500  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.487366  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2553  hypothetical protein  83.49 
 
 
212 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00182  hypothetical protein  39.61 
 
 
208 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.448244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1442  hypothetical protein  39.05 
 
 
208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19705  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  30.88 
 
 
209 aa  89  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  29.21 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  27.75 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  29.13 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  26.17 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  26.57 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  27.86 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  23.15 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  28.64 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  26.57 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  25.25 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  25.25 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  28.92 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  24.54 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  26.34 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  31.21 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  31.21 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  27.59 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  28.43 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  27.44 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  28.43 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  28.99 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  28.24 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  27.94 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  30.26 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  28.57 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  25.58 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  26.73 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  26.73 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  29.13 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  29.13 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  24.17 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  29.61 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  27.45 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  27.45 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  27.45 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  25.47 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  27.96 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  27.94 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  25.32 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  26.73 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  24.53 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  25.12 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  25.12 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  28.19 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  24.88 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  23.45 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  22.69 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  25.12 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  25.71 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  25.12 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  20.6 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  26.07 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  28.44 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  23.11 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  26.2 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  23.94 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  22.57 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  25.91 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  22.22 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  24.76 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  23.19 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  30.09 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  23.92 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  24.53 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  25.12 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  25.79 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  29.03 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  27.6 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  25.84 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  25.73 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  25.73 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  26.11 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  29.75 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  22.07 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  22.54 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  26.89 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  26.19 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  25.12 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  23.47 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  23.47 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  26.64 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1236  phosphate transport regulator  25.69 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  25.57 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  29.53 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  24.04 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>