112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1442 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1442  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19705  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00182  hypothetical protein  87.98 
 
 
208 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.448244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2500  hypothetical protein  39.05 
 
 
212 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.487366  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2553  hypothetical protein  37.26 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  30.84 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  27.64 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  27.14 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  30.81 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  27.75 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  26.79 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  27.14 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  25.58 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  28.78 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  27.59 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  28.92 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  31.19 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  27.22 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  25.25 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  27.63 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  27.03 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  25.82 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  28.57 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  27.94 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  29.94 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  28.95 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  26.95 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  26.95 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  30.19 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  28.1 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  28.38 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  26.06 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  29.52 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  26.07 
 
 
213 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  26.6 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  26.6 
 
 
208 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  28.79 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  25.17 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  29.27 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  27.78 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  26.62 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  24.29 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  28.85 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  24.52 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  26.28 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  26.8 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  26.28 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  26.28 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  25.12 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  21.46 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  25.15 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  21.46 
 
 
210 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  25.15 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  23.15 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  25.15 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  23.9 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  26.47 
 
 
205 aa  48.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  26.28 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  27.61 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  29.63 
 
 
205 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  26.19 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  26.06 
 
 
215 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  24.88 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  26.19 
 
 
208 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  26.79 
 
 
208 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  26.06 
 
 
215 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  26.9 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  26.71 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  26.37 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  21.86 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  26.45 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0776  hypothetical protein  30.54 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  26.44 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  26.62 
 
 
209 aa  45.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  25.3 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  25.87 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  25.45 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  25.9 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  22.49 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  25.7 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  29.63 
 
 
282 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  26.14 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  23.04 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  26.15 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>