155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2745 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  79.02 
 
 
205 aa  338  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  74.63 
 
 
205 aa  327  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  76.59 
 
 
205 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  72.2 
 
 
205 aa  320  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  60 
 
 
210 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  57.62 
 
 
210 aa  242  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  57.77 
 
 
206 aa  242  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  56.86 
 
 
205 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  55.34 
 
 
206 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  57.28 
 
 
206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  54.37 
 
 
206 aa  235  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  57.28 
 
 
206 aa  232  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  53.66 
 
 
205 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  50.48 
 
 
282 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  50.96 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  48.33 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  38.42 
 
 
204 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  38.31 
 
 
208 aa  151  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  34.16 
 
 
205 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  36.95 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  33.66 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  33.66 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  34.48 
 
 
206 aa  134  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  33.66 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  35.1 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  33.82 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  36.71 
 
 
217 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  34.15 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  32.85 
 
 
219 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  33.65 
 
 
205 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  34.13 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  35.44 
 
 
211 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  36.41 
 
 
211 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  34.95 
 
 
211 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  32.84 
 
 
209 aa  121  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  34.95 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  31.88 
 
 
209 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  34.95 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  36.71 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  29.19 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  32.54 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  29.19 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  30.2 
 
 
209 aa  115  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  33.17 
 
 
207 aa  115  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  33.97 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  34.13 
 
 
212 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  31.37 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  31.07 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  29.41 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  29.41 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  30.1 
 
 
207 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  30.24 
 
 
206 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  33.01 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  31.71 
 
 
208 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  32.2 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  29.67 
 
 
212 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  32.2 
 
 
208 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  31.71 
 
 
208 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  31.71 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  32.21 
 
 
209 aa  105  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  28.43 
 
 
206 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  30.54 
 
 
208 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  31.28 
 
 
215 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  31.71 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  31.88 
 
 
208 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  31.19 
 
 
215 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  101  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  30.33 
 
 
215 aa  101  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  30.05 
 
 
203 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 
214 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  29.86 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  27.96 
 
 
215 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  29.61 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  28.91 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  26.47 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  29.59 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>