158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0548 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  43.27 
 
 
208 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  45.67 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  39.9 
 
 
205 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  38.46 
 
 
205 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  38.68 
 
 
205 aa  157  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  40.28 
 
 
206 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  38.94 
 
 
205 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  38.46 
 
 
205 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  38.94 
 
 
205 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  37.93 
 
 
209 aa  142  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  37.44 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  38.42 
 
 
219 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  34.91 
 
 
211 aa  138  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  34.78 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  32.87 
 
 
208 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  33.66 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  32.04 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  32.37 
 
 
211 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21880  phosphate transport regulator related to PhoU  32.67 
 
 
211 aa  125  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  32.69 
 
 
209 aa  124  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  31.25 
 
 
206 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  32.37 
 
 
211 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  31.4 
 
 
211 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  31.88 
 
 
211 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  33.17 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  32.55 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  32.06 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  32.85 
 
 
213 aa  118  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  30.43 
 
 
205 aa  117  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  33.01 
 
 
209 aa  117  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  36.41 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  34.63 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  29.19 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  29.19 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  31.43 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  28.97 
 
 
210 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  31.92 
 
 
206 aa  115  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  32.52 
 
 
208 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  32.52 
 
 
208 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  34.47 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  34.47 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  33.98 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  33.98 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  33.98 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  29.81 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  33.01 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  33.98 
 
 
206 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  34.31 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  31.28 
 
 
282 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  30.43 
 
 
214 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  28.71 
 
 
211 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  33.82 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  33.82 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  33.82 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  33.82 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  28.71 
 
 
206 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  28.5 
 
 
205 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  31.68 
 
 
204 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  31.55 
 
 
209 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  30.58 
 
 
208 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  35.44 
 
 
206 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  29.05 
 
 
208 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  31.71 
 
 
207 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  31.25 
 
 
207 aa  105  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  27.94 
 
 
207 aa  104  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  28.5 
 
 
205 aa  104  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  30.58 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  27.4 
 
 
206 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  30.1 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  31.03 
 
 
208 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  28.29 
 
 
203 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  29.05 
 
 
214 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  30 
 
 
214 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  28.71 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  28.78 
 
 
214 aa  99  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  29.52 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  29.06 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  29.19 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>