156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1398 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  86.51 
 
 
215 aa  390  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  86.51 
 
 
215 aa  390  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  86.51 
 
 
215 aa  387  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  85.05 
 
 
214 aa  377  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  82.79 
 
 
215 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  83.26 
 
 
215 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  78.6 
 
 
215 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  68.84 
 
 
215 aa  316  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  69.3 
 
 
215 aa  309  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  58.14 
 
 
215 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  57.21 
 
 
215 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  57.87 
 
 
208 aa  241  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  58.8 
 
 
208 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  56.07 
 
 
208 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  56.07 
 
 
208 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  53.74 
 
 
208 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  53.74 
 
 
208 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  53.74 
 
 
208 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  53.74 
 
 
208 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  53.74 
 
 
208 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  55.61 
 
 
208 aa  228  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  225  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  53.27 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  53.74 
 
 
208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  53.74 
 
 
208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  53.74 
 
 
208 aa  224  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  52.8 
 
 
208 aa  224  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  51.63 
 
 
212 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  47.2 
 
 
208 aa  190  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  39.52 
 
 
205 aa  157  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  40 
 
 
205 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  39.05 
 
 
205 aa  154  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  41.43 
 
 
205 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  39.52 
 
 
205 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  36.67 
 
 
206 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  37.38 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  38.14 
 
 
211 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  38.14 
 
 
211 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  37.91 
 
 
204 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  38.14 
 
 
211 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  35.05 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  35.24 
 
 
219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  35.24 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  32.09 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  34.42 
 
 
209 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
209 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  33.18 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  33.64 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  33.49 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  34.74 
 
 
217 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  33.81 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  35.62 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  33.03 
 
 
212 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  34.48 
 
 
204 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  33.8 
 
 
213 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  30.52 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  32.51 
 
 
204 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  32.23 
 
 
205 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  32.87 
 
 
213 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  28.71 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  30.33 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  30.48 
 
 
209 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  34.26 
 
 
390 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  33.02 
 
 
214 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  29.81 
 
 
208 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 
205 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  31.94 
 
 
209 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  30.33 
 
 
206 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  30.33 
 
 
205 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  30.33 
 
 
206 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  31.63 
 
 
218 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  28.5 
 
 
207 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  29.72 
 
 
206 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  31.16 
 
 
215 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  31.02 
 
 
206 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  33.02 
 
 
211 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  28.37 
 
 
210 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  31.07 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  29.49 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  29.86 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  32.39 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  32.09 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  27.96 
 
 
205 aa  99  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  30.37 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  31.94 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  31.78 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  30.23 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  33.18 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  30.62 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  30.62 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>