149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2678 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  69.48 
 
 
213 aa  310  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  45.54 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  46.26 
 
 
217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  45.19 
 
 
204 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  40.98 
 
 
205 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  41.18 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  39.71 
 
 
205 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  39.13 
 
 
205 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  39.71 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  40.78 
 
 
205 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  40 
 
 
205 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  36.97 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  34.11 
 
 
215 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  35.98 
 
 
215 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  35.05 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  35.05 
 
 
215 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  36.92 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  34.88 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  34.88 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  35.81 
 
 
215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  34.88 
 
 
215 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  35.05 
 
 
215 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  34.11 
 
 
215 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  37.38 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  33.82 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  34.29 
 
 
208 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  33.01 
 
 
209 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  35.44 
 
 
204 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  34.12 
 
 
208 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  35.07 
 
 
209 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  34.95 
 
 
206 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  36.02 
 
 
209 aa  123  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  34.76 
 
 
208 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  35.92 
 
 
205 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  34.76 
 
 
208 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  34.76 
 
 
208 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  33.81 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  34.12 
 
 
208 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  34.95 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  34.12 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  37.87 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  34.58 
 
 
215 aa  118  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  31.31 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  33.02 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  34.12 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  36.81 
 
 
211 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  36.81 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  36.81 
 
 
211 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  32.21 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  34.47 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  33.01 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  34.47 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  35.61 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  36.84 
 
 
212 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  31.73 
 
 
219 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  35.8 
 
 
208 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  32.85 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  35.54 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  31.86 
 
 
209 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 
211 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  30.1 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  36.53 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  33.93 
 
 
204 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  31.88 
 
 
206 aa  101  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  33.65 
 
 
205 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  34.45 
 
 
206 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  34.81 
 
 
203 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  28.06 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  30.29 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  31.37 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  33.49 
 
 
282 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  28.29 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  29.34 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  33.01 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>