157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0299 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  100 
 
 
206 aa  416  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  68.93 
 
 
206 aa  295  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  66.5 
 
 
206 aa  289  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  69.9 
 
 
206 aa  284  8e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  61.9 
 
 
210 aa  268  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  58.25 
 
 
205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  55.83 
 
 
205 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  54.37 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  55.34 
 
 
205 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  57.14 
 
 
210 aa  238  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  53.4 
 
 
205 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  52.91 
 
 
206 aa  230  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  55.34 
 
 
205 aa  228  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  52.91 
 
 
205 aa  224  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  47.62 
 
 
209 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  47.37 
 
 
282 aa  194  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  46.41 
 
 
208 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  38.24 
 
 
204 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  38.12 
 
 
208 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  37.56 
 
 
206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  35.44 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  34.8 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  34.93 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  32.02 
 
 
205 aa  128  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  32.84 
 
 
205 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  37.26 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  32.51 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  31.55 
 
 
230 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  36.06 
 
 
209 aa  121  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  35.1 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  35.1 
 
 
209 aa  117  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  31.07 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  33.18 
 
 
215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  34.45 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  34.15 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  36.02 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  31.46 
 
 
215 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  33.66 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  29.81 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  29.81 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  30.81 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  32.2 
 
 
209 aa  109  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  31.43 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  35.27 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  32.54 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  33.01 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  35.27 
 
 
211 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  34.78 
 
 
211 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  32.68 
 
 
209 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  29.86 
 
 
215 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  29.86 
 
 
215 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  30.84 
 
 
215 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  31.88 
 
 
207 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  29.86 
 
 
215 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  33.82 
 
 
211 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  31.25 
 
 
214 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
213 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  31.28 
 
 
215 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  29.91 
 
 
215 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  26.6 
 
 
207 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  31.88 
 
 
213 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  32.86 
 
 
212 aa  101  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  31.4 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07400  hypothetical protein  30.24 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  28.91 
 
 
214 aa  98.6  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  32.37 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  32.04 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  33.18 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  31.55 
 
 
208 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  32.34 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  32.21 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  31.55 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  31.5 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  31.48 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  31.07 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  30.88 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  32.54 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  29.05 
 
 
214 aa  95.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  32.23 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  32.54 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  28.78 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  32.54 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>