164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3782 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  98.54 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  89.76 
 
 		 205 aa  383  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  81.46 
 
 		 205 aa  353  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  79.51 
 
 		 205 aa  343  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  76.59 
 
 		 205 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  73.3 
 
 		 206 aa  313  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  54.15 
 
 		 204 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  42.44 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  43.27 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  41.95 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  41.46 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  41.95 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  42.03 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  41.95 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  41.83 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  41.5 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  45.1 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  43 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  43.63 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  41.35 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  41.35 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  41.35 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  41.35 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  39.25 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  41.35 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  41.35 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  40.87 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  38.79 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  40.19 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  40.76 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  39.52 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  39.42 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  39.05 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  40.38 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  40.38 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  40.38 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  39.25 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  39.72 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  38.32 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  38.32 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  38.94 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  41.75 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  39.9 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  37.86 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  39.71 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  43.55 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  38.32 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  38.65 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  38.16 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  42.38 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  38.35 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  37.81 
 
 		 205 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  37.74 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  37.25 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  41.67 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  39.9 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  38.46 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  36.45 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  35.1 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  39.6 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  39.6 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  36.54 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  39.6 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  40.1 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  40.1 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  39.5 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  39.6 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  38.35 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  35.27 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  39.11 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  39.11 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  39.11 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  39.11 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  35.78 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  39.11 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  35.29 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  34.16 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  33.17 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  35.64 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  36.45 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  34.78 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  36.14 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  34.3 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  33.82 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  32.86 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  31.9 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  34.62 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  34.12 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>