158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0739 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  67.14 
 
 
205 aa  286  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  64.76 
 
 
205 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  64.29 
 
 
205 aa  271  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  62.02 
 
 
205 aa  261  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  60 
 
 
205 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  59.81 
 
 
210 aa  251  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  57.14 
 
 
206 aa  244  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  60 
 
 
206 aa  244  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  57.62 
 
 
205 aa  241  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  57.14 
 
 
206 aa  238  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  60.48 
 
 
206 aa  237  8e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  54.93 
 
 
208 aa  224  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  54.46 
 
 
282 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  52.38 
 
 
206 aa  222  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  55.71 
 
 
205 aa  218  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  52.8 
 
 
209 aa  214  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  41.83 
 
 
204 aa  161  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  38.6 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  37.86 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  34.3 
 
 
205 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  34.3 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  35.1 
 
 
205 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  35.1 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  33.82 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  34.13 
 
 
206 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  37.91 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  34.13 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  35.85 
 
 
209 aa  125  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  33.01 
 
 
206 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  36.74 
 
 
209 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  33.96 
 
 
209 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  35 
 
 
209 aa  121  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  35.1 
 
 
217 aa  121  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  37.26 
 
 
211 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  32.55 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  32.55 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  37.26 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  37.26 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  34.45 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  35.89 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  31.9 
 
 
230 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  36.02 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  31.92 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  36.54 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  33.01 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  32.56 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  31.58 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  31.92 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  31.92 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  32.7 
 
 
208 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  32.69 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  32.69 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  30.52 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  30.52 
 
 
209 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  32.71 
 
 
209 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  30 
 
 
215 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  30.52 
 
 
215 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  31.73 
 
 
208 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  35.11 
 
 
209 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  30.49 
 
 
214 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  32.21 
 
 
207 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  30.52 
 
 
215 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  31.25 
 
 
208 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  34.11 
 
 
214 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  34.12 
 
 
214 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  28.96 
 
 
215 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  30.41 
 
 
212 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  33.8 
 
 
214 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  35.21 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  31.74 
 
 
205 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  31.74 
 
 
205 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  32.52 
 
 
207 aa  99  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  31.74 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  33.18 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  27.73 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  30.62 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  27.96 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  33.18 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  33.54 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>