147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0776 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0776  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116713 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  64.02 
 
 
214 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  61.21 
 
 
214 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  57.48 
 
 
218 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  58.88 
 
 
213 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  55.14 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  56.07 
 
 
214 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  57.01 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  58.6 
 
 
214 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  54.67 
 
 
214 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  55.61 
 
 
214 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  55.61 
 
 
214 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  55.14 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  53.27 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  52.58 
 
 
390 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  52.11 
 
 
214 aa  221  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0842  hypothetical protein  44.86 
 
 
215 aa  177  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  36.49 
 
 
211 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  34.12 
 
 
211 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  34.12 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  34.12 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  35.27 
 
 
211 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  32.08 
 
 
208 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  30.14 
 
 
208 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  34.31 
 
 
205 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  32.39 
 
 
212 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  30.77 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  30.1 
 
 
205 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  30.1 
 
 
205 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  29.61 
 
 
206 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  30.29 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  30.29 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  30.29 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  30.29 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  30.29 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  30.29 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  30.29 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  30.24 
 
 
205 aa  101  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  34.63 
 
 
206 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  31.73 
 
 
209 aa  101  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  29.61 
 
 
205 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  32.21 
 
 
206 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  33.66 
 
 
206 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  29.38 
 
 
214 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  28.16 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  29.67 
 
 
209 aa  99  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  29.61 
 
 
205 aa  98.6  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  29.27 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  31.58 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  37.26 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  28.77 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  32.35 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  29.95 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  29.05 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  29.05 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  27.75 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  27.75 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  31.55 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  28.71 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  29.76 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  31.86 
 
 
204 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  31.16 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  31.07 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  28.71 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  26.79 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  35.92 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  33.66 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  34.62 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  29.91 
 
 
215 aa  92  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  31.25 
 
 
206 aa  92  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  30.58 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  27.91 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  30.88 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  25.71 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  25.71 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  25.59 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  29.44 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  28.57 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  29.44 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  28.85 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  28.5 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  28.5 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  32.41 
 
 
282 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  30.29 
 
 
209 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  28.84 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  28.84 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  27.05 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  27.1 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  27.57 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  28.5 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  31.13 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>