150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0643 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  100 
 
 
207 aa  427  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  43 
 
 
207 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  33.01 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21880  phosphate transport regulator related to PhoU  31.28 
 
 
211 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  33.99 
 
 
207 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  32.54 
 
 
209 aa  121  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  29.27 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  30.88 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  29.41 
 
 
205 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  31.71 
 
 
210 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  31.71 
 
 
210 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  35.5 
 
 
205 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  29.56 
 
 
209 aa  105  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  27.05 
 
 
206 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  29.06 
 
 
205 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  29.06 
 
 
205 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  29.06 
 
 
205 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  30.05 
 
 
208 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  29.41 
 
 
208 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  34.63 
 
 
205 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  34 
 
 
205 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  28.99 
 
 
207 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  30.65 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  30.65 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  28.22 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  32.52 
 
 
210 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  30.65 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  28.02 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  31.22 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  28.08 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  30.15 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  30.65 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  30.58 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  29.13 
 
 
282 aa  94.7  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  33.01 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  29.13 
 
 
208 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  27.72 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  30.54 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  27.72 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  27.09 
 
 
209 aa  92  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  31.37 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  27.59 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  30.92 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  28.57 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  30.39 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  28.5 
 
 
211 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  29.95 
 
 
215 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  29.95 
 
 
215 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  29.95 
 
 
215 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  28.99 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  28.23 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  29 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  28 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  28.5 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  27.23 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  28.71 
 
 
212 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  28.43 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  29.95 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  29.06 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  29.61 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  26.24 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  27.67 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  30.56 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  30.1 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  26.11 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  29.47 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  28.78 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  27.05 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  27.45 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  26.6 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  30.54 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  26.13 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  25.25 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  29.5 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  23.65 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  25.63 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  25.63 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  25.63 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  25.63 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  26.79 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  28.14 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  25.63 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2553  hypothetical protein  25.24 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  26.6 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  30.56 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  30.56 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  25.63 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2500  hypothetical protein  23.15 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.487366  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  25.63 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>